More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3529 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  100 
 
 
323 aa  647    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3073  alcohol dehydrogenase  68.35 
 
 
333 aa  404  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341638  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11890  alcohol dehydrogenase adhA  64.06 
 
 
346 aa  392  1e-108  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.594038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3343  alcohol dehydrogenase  67.94 
 
 
332 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0866379 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1113  alcohol dehydrogenase  65.72 
 
 
338 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1096  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  65.72 
 
 
338 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.59136  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1124  alcohol dehydrogenase  65.72 
 
 
338 aa  378  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1805  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  63.24 
 
 
332 aa  374  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.352435  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1330  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  57.78 
 
 
380 aa  365  1e-100  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2709  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.63 
 
 
334 aa  363  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1535  zinc-binding alcohol dehydrogenase  55.42 
 
 
348 aa  362  4e-99  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0343  alcohol dehydrogenase  60.57 
 
 
333 aa  359  4e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4103  putative alcohol dehydrogenase  62.74 
 
 
332 aa  358  6e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.409258  normal  0.240324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6571  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  56.98 
 
 
358 aa  358  6e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2022  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  60.87 
 
 
332 aa  358  7e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000478739  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0264  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  61.18 
 
 
332 aa  347  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.825688 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0138  alcohol dehydrogenase  57.1 
 
 
337 aa  343  2e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0829  alcohol dehydrogenase  48.14 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0303  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.75 
 
 
332 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5710  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.26 
 
 
328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0121  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  51.26 
 
 
338 aa  298  1e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0116  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.92 
 
 
327 aa  297  2e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0056  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  52.37 
 
 
329 aa  296  3e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3850  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.62 
 
 
324 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1192  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.92 
 
 
332 aa  291  9e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4129  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  51.27 
 
 
328 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140099 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1937  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  47.91 
 
 
344 aa  289  3e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1118  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  53.16 
 
 
329 aa  289  4e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.439125 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0778  alcohol dehydrogenase  47.11 
 
 
333 aa  288  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0378  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.84 
 
 
327 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0909  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50 
 
 
328 aa  285  9e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.543563  normal  0.200442 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5373  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.62 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2439  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  48.1 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00520029 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00880  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  51.58 
 
 
327 aa  281  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4206  alcohol dehydrogenase  51.91 
 
 
327 aa  280  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773596  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3411  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.77 
 
 
341 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0749603  normal  0.0972256 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3003  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.92 
 
 
347 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.410653  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2413  hypothetical protein  43.89 
 
 
328 aa  273  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1061  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.89 
 
 
327 aa  272  6e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.215754  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2558  hypothetical protein  43.57 
 
 
328 aa  272  6e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1026  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.89 
 
 
327 aa  272  6e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1744  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.48 
 
 
335 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0255685 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2442  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.63 
 
 
327 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1418  zinc-binding alcohol dehydrogenase  50.32 
 
 
327 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2529  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.32 
 
 
327 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.199316  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.45 
 
 
332 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2088  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.48 
 
 
335 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0046  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  46.15 
 
 
336 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173418  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1844  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  45.54 
 
 
328 aa  270  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.364019  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2449  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  50.94 
 
 
331 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185569  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6316  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.23 
 
 
328 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1916  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  44.89 
 
 
327 aa  267  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.317656  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2010  alcohol dehydrogenase zinc-binding type 2  46.56 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2299  alcohol dehydrogenase  46.08 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.795546  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5774  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.6 
 
 
328 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3463  alcohol dehydrogenase  49.06 
 
 
334 aa  265  7e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0573  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47 
 
 
330 aa  264  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.526868  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4710  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.26 
 
 
331 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.525688  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4482  alcohol dehydrogenase  44.92 
 
 
328 aa  264  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4279  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.98 
 
 
329 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0922746 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4437  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.2 
 
 
336 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4570  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.2 
 
 
336 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0690283  normal  0.180174 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1412  alcohol dehydrogenase  46.52 
 
 
338 aa  260  3e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.498942 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3811  alcohol dehydrogenase  46.13 
 
 
329 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.367901  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0630  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  40.99 
 
 
344 aa  257  2e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2263  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  45.43 
 
 
328 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5905  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.62 
 
 
329 aa  255  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.22496 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0459  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  46.77 
 
 
328 aa  254  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1201  putative alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  44.92 
 
 
329 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478337  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0163  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.08 
 
 
328 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1018  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.08 
 
 
328 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0189  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.08 
 
 
328 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2605  putative oxidoreductase  47.08 
 
 
328 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1333  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  47.08 
 
 
328 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2748  putative oxidoreductase  47.08 
 
 
328 aa  252  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5755  putative alcohol dehydrogenase  45.89 
 
 
329 aa  249  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.667662  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2296  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  46.71 
 
 
345 aa  249  4e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0277676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1505  alcohol dehydrogenase-like oxidoreductase protein  46.86 
 
 
334 aa  248  7e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0775  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  44.55 
 
 
342 aa  247  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0426  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  44.38 
 
 
327 aa  240  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6106  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  47.02 
 
 
326 aa  232  8.000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2614  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  43.12 
 
 
327 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.988218  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5387  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  45.14 
 
 
326 aa  229  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0165  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  44.83 
 
 
304 aa  229  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0352  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.76 
 
 
338 aa  217  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1084  zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein  40 
 
 
342 aa  209  3e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31  normal  0.438887 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0237  alcohol dehydrogenase  35.74 
 
 
336 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.15535  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  35.49 
 
 
336 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  34.13 
 
 
342 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  35.09 
 
 
342 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  33.53 
 
 
342 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  34.43 
 
 
340 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  37.61 
 
 
341 aa  179  7e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.91 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  36.09 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.78 
 
 
342 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  35.49 
 
 
344 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  35.98 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  34.78 
 
 
343 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>