More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3475 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3475  response regulator receiver  100 
 
 		 228 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.849127  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5522  two component LuxR family transcriptional regulator  66.05 
 
 		 219 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1410  two component transcriptional regulator, LuxR family  66.05 
 
 		 222 aa  255  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.46664  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2472  two component transcriptional regulator, LuxR family  58.14 
 
 		 221 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0113125  hitchhiker  0.00367669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1619  two component LuxR family transcriptional regulator  65.85 
 
 		 163 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.113726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  65.85 
 
 		 163 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1592  two component LuxR family transcriptional regulator  66.26 
 
 		 162 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  45.28 
 
 		 213 aa  191  6e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  52.58 
 
 		 215 aa  191  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.77 
 
 		 215 aa  188  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.502704  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.81 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2533  response regulator receiver protein  46.76 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.495874 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0523  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.55 
 
 		 230 aa  185  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1796  response regulator receiver  47.3 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1782  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6427  two component LuxR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 238 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  50 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3185  two component LuxR family transcriptional regulator  48.2 
 
 		 223 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.704721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  49.77 
 
 		 227 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7606  response regulator receiver protein  48.83 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26840  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  46.76 
 
 		 239 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274056  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4468  response regulator receiver protein  48.6 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0876299  normal  0.32237 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.29 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.85 
 
 		 229 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  47.53 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4860  two component LuxR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 219 aa  175  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452521  normal  0.0798716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 234 aa  174  8e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7658  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.44 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.4 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4652  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.17 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1020  response regulator receiver  46.76 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.648692  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.89 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0172663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  47.47 
 
 		 220 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1477  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.27 
 
 		 234 aa  171  5.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2302  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 226 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0191252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2458  response regulator receiver  46.33 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0554598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.37 
 
 		 220 aa  171  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 218 aa  171  9e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  46.26 
 
 		 215 aa  169  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0651  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.39 
 
 		 241 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  45.62 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  46.98 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8900  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.05 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.967084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2469  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.45 
 
 		 214 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4260  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 217 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5265  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.91 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11600  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  46.19 
 
 		 225 aa  169  5e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00120804  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2557  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 224 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.0978001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0199  response regulator receiver protein  46.19 
 
 		 213 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.61 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4115  response regulator receiver protein  45.5 
 
 		 216 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.071707  normal  0.0608108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8412  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.59 
 
 		 239 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4051  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00308286  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7812  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.7 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.66 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4937  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.42 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.570807  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1269  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7415  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.49 
 
 		 228 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.73 
 
 		 219 aa  166  4e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2822  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 231 aa  165  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  46.01 
 
 		 216 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5499  response regulator receiver protein  45.75 
 
 		 213 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00659712  normal  0.108677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4491  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.84 
 
 		 225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  44.71 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  44.44 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  43.5 
 
 		 489 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0683  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.92 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.344925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0175  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.76 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6705  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.37 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318103  normal  0.0731204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.22 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3337  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.69 
 
 		 254 aa  162  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0952095  normal  0.130531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6963  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.38 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.029709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0601  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.19 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4263  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.78 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0110  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0102  two component transcriptional regulator, LuxR family  45 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0637251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.15 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.09 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3040  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.4 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0154763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0549  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.37 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3519  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.12 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.25 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25060  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  41.98 
 
 		 222 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.444591  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5656  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.12 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 207 aa  158  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  43.46 
 
 		 220 aa  158  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4896  response regulator receiver  45.28 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.446448  normal  0.220667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8793  response regulator receiver protein  42.79 
 
 		 221 aa  158  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>