24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3407 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3407  patatin-related protein  100 
 
 		 818 aa  1664    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1083  patatin  27.33 
 
 		 818 aa  207  7e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0553  Patatin  27.24 
 
 		 828 aa  194  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4091  patatin  26.72 
 
 		 774 aa  177  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25380  Patatin-like phospholipase  25.85 
 
 		 825 aa  171  6e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.969394  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2615  patatin  26.14 
 
 		 926 aa  166  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0888746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2089  patatin  26.31 
 
 		 830 aa  162  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0919743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0742  patatin  25.98 
 
 		 816 aa  161  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.885952  normal  0.0715613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1052  patatin  30.99 
 
 		 1171 aa  155  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1602  Patatin  27.37 
 
 		 1137 aa  150  8e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0045  Patatin  32.6 
 
 		 1107 aa  145  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.604758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0030  patatin  30.29 
 
 		 770 aa  130  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.491773  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2051  hypothetical protein  29.06 
 
 		 773 aa  120  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.475949  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3961  Patatin  27.87 
 
 		 1056 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5555  patatin  28.37 
 
 		 954 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2776  Patatin  29.78 
 
 		 1383 aa  102  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1147  patatin-related protein  30.75 
 
 		 818 aa  101  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0770474  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2668  hypothetical protein  30.38 
 
 		 978 aa  93.6  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7272  patatin  27.68 
 
 		 1101 aa  77  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.341762  normal  0.239541 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1675  patatin family phospholipase  30.11 
 
 		 1153 aa  76.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160434  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13514  hypothetical protein  38.26 
 
 		 1031 aa  64.7  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.577448 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0052  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1142 aa  59.3  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5159  Patatin  26.79 
 
 		 1320 aa  58.2  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.51871  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5025  Patatin  24.37 
 
 		 563 aa  54.3  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.155032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>