18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3296 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3296  hypothetical protein  100 
 
 		 586 aa  1123    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0120256  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0334  hypothetical protein  30.67 
 
 		 717 aa  124  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04320  hypothetical protein  31.42 
 
 		 386 aa  93.2  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.271087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5453  hypothetical protein  29.01 
 
 		 702 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6577  hypothetical protein  25.8 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.812843  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13920  hypothetical protein  26.07 
 
 		 537 aa  67.4  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3368  hypothetical protein  41.72 
 
 		 504 aa  64.7  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5490  hypothetical protein  25.84 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.12458  normal  0.584277 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0077  hypothetical protein  25.1 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0086  hypothetical protein  25.1 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.884543  normal  0.0136026 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0067  hypothetical protein  25.1 
 
 		 465 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0999093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0675  hypothetical protein  32.28 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.230217 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13917  hypothetical protein  25.82 
 
 		 462 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.791401 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5782  hypothetical protein  25.75 
 
 		 568 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0817507  normal  0.0904158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0091  hypothetical protein  26.67 
 
 		 465 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466213  normal  0.124758 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0756  hypothetical protein  25.76 
 
 		 465 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4443  hypothetical protein  33.61 
 
 		 628 aa  47.8  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0183712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0987  hypothetical protein  34.86 
 
 		 392 aa  44.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>