More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3294 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3294  monooxygenase FAD-binding protein  100 
 
 
388 aa  796    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0802651  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5278  monooxygenase, FAD-binding  74.42 
 
 
395 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.630865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2710  monooxygenase FAD-binding  56.01 
 
 
392 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2962  monooxygenase FAD-binding protein  56.3 
 
 
397 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2318  monooxygenase FAD-binding  55.47 
 
 
385 aa  433  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.694664  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3565  monooxygenase FAD-binding  54.95 
 
 
384 aa  421  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1784  monooxygenase, FAD-binding  46.5 
 
 
410 aa  336  5e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  32.41 
 
 
404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  33.06 
 
 
404 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  32.51 
 
 
404 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  31.78 
 
 
404 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  32.05 
 
 
422 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2339  monooxygenase FAD-binding  33.53 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000167175  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0809  monooxygenase, FAD-binding  31.53 
 
 
396 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.815643  normal  0.21546 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  32.36 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4211  monooxygenase, FAD-binding  33.43 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.815591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3466  monooxygenase, FAD-binding  31.01 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4900  monooxygenase, FAD-binding  31.01 
 
 
392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.99121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2257  hypothetical protein  29.28 
 
 
378 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.472155 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1889  hypothetical protein  30.06 
 
 
374 aa  139  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  31.76 
 
 
388 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5386  monooxygenase FAD-binding  30.7 
 
 
392 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.336288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5319  monooxygenase FAD-binding protein  31.52 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  30.73 
 
 
410 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  32.12 
 
 
406 aa  133  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  30.62 
 
 
391 aa  132  9e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3960  monooxygenase, FAD-binding  31.85 
 
 
388 aa  132  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  33.05 
 
 
382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  33.99 
 
 
382 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  33.05 
 
 
382 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  33.05 
 
 
382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  29.53 
 
 
385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  28.38 
 
 
385 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2527  monooxygenase FAD-binding protein  30.42 
 
 
388 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  29.24 
 
 
385 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  28.91 
 
 
697 aa  126  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  31.38 
 
 
387 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4581  monooxygenase FAD-binding protein  31.86 
 
 
399 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.626069 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2230  hypothetical protein  24.85 
 
 
377 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000757274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1987  hypothetical protein  24.85 
 
 
377 aa  123  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000746962  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4602  monooxygenase FAD-binding  29.89 
 
 
382 aa  123  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.296431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1969  hypothetical protein  24.54 
 
 
377 aa  123  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0438709  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  29.58 
 
 
402 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0096  monooxygenase FAD-binding  28.76 
 
 
388 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0544698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  29.57 
 
 
386 aa  123  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1093  monooxygenase, FAD-binding  30.24 
 
 
369 aa  122  8e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.363504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2005  hypothetical protein  24.48 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00436005  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  31.49 
 
 
421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4378  monooxygenase FAD-binding  30.68 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.760367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5557  FAD-dependent oxidoreductase  31.07 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.633311 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0712  hypothetical protein  30.38 
 
 
371 aa  120  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0982  monooxygenase FAD-binding  30.82 
 
 
369 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.240273  decreased coverage  0.000117397 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2701  monooxygenase FAD-binding protein  33.04 
 
 
377 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  27.43 
 
 
403 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  30.06 
 
 
402 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5437  monooxygenase, FAD-binding  29.48 
 
 
364 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.863729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5727  monooxygenase, FAD-binding  29.48 
 
 
364 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0778  monooxygenase FAD-binding  30.31 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373747  decreased coverage  0.000456942 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0229  monooxygenase FAD-binding  29.53 
 
 
409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.297351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7785  FAD-dependent oxidoreductase  29.75 
 
 
425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786204  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3561  monooxygenase, FAD-binding protein  28.8 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.014092  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  29.77 
 
 
402 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  28.8 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3634  monooxygenase, FAD-binding  28.8 
 
 
389 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.231418  normal  0.598375 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  30.27 
 
 
399 aa  117  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4002  monooxygenase FAD-binding  27.09 
 
 
376 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_1611  zeaxanthin epoxidase (ABA1) (NPQ2)  28.37 
 
 
429 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.539309  normal  0.0529961 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6537  monooxygenase, FAD-binding protein  31.67 
 
 
392 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0203356  normal  0.0154804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5348  monooxygenase, FAD-binding protein  29.28 
 
 
360 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.437085  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  29.73 
 
 
385 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  28.73 
 
 
402 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  29.94 
 
 
373 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  29.92 
 
 
385 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3957  monooxygenase FAD-binding  27 
 
 
376 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  29.05 
 
 
383 aa  116  6e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2372  hypothetical protein  27.19 
 
 
374 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2329  hypothetical protein  27.19 
 
 
374 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  29.73 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5335  FAD-dependent monooxygenase  28.27 
 
 
378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103313  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  29.73 
 
 
385 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  29.21 
 
 
448 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  32.88 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  28.94 
 
 
396 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  26.65 
 
 
378 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3328  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.82 
 
 
407 aa  113  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150159  normal  0.347251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4138  monooxygenase, FAD-binding protein  31.17 
 
 
408 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145497  normal  0.0296411 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  28.61 
 
 
402 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1486  monooxygenase FAD-binding protein  28.18 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.528879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  29.36 
 
 
397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  29.16 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  30.95 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  28.49 
 
 
377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  27.35 
 
 
400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5812  monooxygenase, FAD-binding protein  30.43 
 
 
408 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  27.65 
 
 
412 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  30.48 
 
 
430 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2369  monooxygenase FAD-binding protein  33.33 
 
 
371 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  28.7 
 
 
386 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4393  monooxygenase FAD-binding  28.65 
 
 
377 aa  108  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30630  putative FAD-dependent monooxygenase  30.74 
 
 
382 aa  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0241073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>