176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3273 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  100 
 
 		 213 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  35.07 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 206 aa  99  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  34.74 
 
 		 203 aa  89.4  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  32.52 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  32.52 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  32.52 
 
 		 225 aa  88.2  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 200 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 250 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 258 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 263 aa  61.6  0.000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 242 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  30.41 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 209 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  29.59 
 
 		 241 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  25.6 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  26.19 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  28.77 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 250 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 271 aa  48.9  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  31.93 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 272 aa  48.1  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.3 
 
 		 343 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  42.5 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  25.46 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  30.49 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  25.71 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 268 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  43.84 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  47.17 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 265 aa  45.8  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1118  regulatory protein TetR  41.18 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 249 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  44.26 
 
 		 168 aa  45.8  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  35.96 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 278 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 167 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 268 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>