More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3237 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  100 
 
 		 344 aa  697    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  66.86 
 
 		 341 aa  457  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  68.04 
 
 		 341 aa  447  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  64.22 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  61.24 
 
 		 339 aa  411  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  61.29 
 
 		 342 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  59.24 
 
 		 341 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  57.77 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  57.02 
 
 		 341 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  55.85 
 
 		 341 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  56.3 
 
 		 341 aa  368  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  56.6 
 
 		 341 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  56.6 
 
 		 341 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  57.31 
 
 		 342 aa  366  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  54.84 
 
 		 341 aa  364  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  54.84 
 
 		 341 aa  363  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  56.14 
 
 		 346 aa  360  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  54.84 
 
 		 342 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  56.56 
 
 		 342 aa  356  2.9999999999999997e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  55.13 
 
 		 342 aa  356  3.9999999999999996e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  54.84 
 
 		 340 aa  353  2e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  52.02 
 
 		 348 aa  324  1e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  49.57 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  50.86 
 
 		 345 aa  317  3e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  50.86 
 
 		 345 aa  312  4.999999999999999e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  48.26 
 
 		 340 aa  311  9e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  49.71 
 
 		 343 aa  311  1e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  50.73 
 
 		 344 aa  310  2e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  49.42 
 
 		 343 aa  309  4e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  49.71 
 
 		 343 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  48.39 
 
 		 341 aa  305  6e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  48.55 
 
 		 341 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  48.26 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  48.26 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  48.26 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  47.56 
 
 		 349 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  49.71 
 
 		 343 aa  301  1e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  48.22 
 
 		 343 aa  296  5e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  48.13 
 
 		 368 aa  291  2e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  46.97 
 
 		 344 aa  289  6e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  48.99 
 
 		 368 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  48.54 
 
 		 365 aa  284  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  47.98 
 
 		 364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  44.41 
 
 		 346 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  47.09 
 
 		 363 aa  279  4e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  45.82 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000403027  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2244  phosphofructokinase  48.25 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.347651  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  47.83 
 
 		 370 aa  276  3e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  49.57 
 
 		 373 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  46.65 
 
 		 366 aa  274  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  46.65 
 
 		 365 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  45.87 
 
 		 369 aa  268  7e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  47.11 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  45.38 
 
 		 367 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3671  phosphofructokinase  44.77 
 
 		 370 aa  265  7e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  46.45 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000305135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  44.79 
 
 		 363 aa  265  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  47.38 
 
 		 358 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  44.91 
 
 		 372 aa  258  7e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  45.48 
 
 		 365 aa  258  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  43.96 
 
 		 372 aa  257  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  44.86 
 
 		 372 aa  256  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3475  6-phosphofructokinase  43.58 
 
 		 378 aa  255  6e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17741  normal  0.337897 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  46.61 
 
 		 356 aa  255  8e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  45.1 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  46.49 
 
 		 375 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1265  6-phosphofructokinase  42.26 
 
 		 322 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000177376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  45.06 
 
 		 363 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000980056  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  44.32 
 
 		 368 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  44.16 
 
 		 361 aa  249  5e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000140469 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  44.64 
 
 		 359 aa  248  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  42.98 
 
 		 360 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0615  6-phosphofructokinase  44.51 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0161189 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3976  6-phosphofructokinase  43.07 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00297784 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1261  6-phosphofructokinase  39.47 
 
 		 324 aa  242  7e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0676  6-phosphofructokinase  41.37 
 
 		 319 aa  239  4e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  43.88 
 
 		 319 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  44.91 
 
 		 342 aa  239  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  43.75 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  43.62 
 
 		 350 aa  238  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  43.3 
 
 		 364 aa  236  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3101  6-phosphofructokinase  42.86 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.165098 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  43.32 
 
 		 350 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2686  6-phosphofructokinase  42.69 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000257847  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3979  6-phosphofructokinase  45.09 
 
 		 360 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00166212  hitchhiker  0.00122812 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3930  6-phosphofructokinase  45.09 
 
 		 360 aa  235  7e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2612  6-phosphofructokinase  39.82 
 
 		 327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  43.11 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  39.88 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  39.88 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  42.86 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000104743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03210  6-phosphofructokinase  38.87 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000506953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  40.35 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4308  6-phosphofructokinase  40.35 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  40.35 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4460  6-phosphofructokinase  40.35 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.430831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4393  6-phosphofructokinase  40.35 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.481829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2261  6-phosphofructokinase  39.83 
 
 		 331 aa  224  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00253507  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2362  6-phosphofructokinase  41.19 
 
 		 326 aa  223  4e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0336  6-phosphofructokinase  40.95 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>