More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3185 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  100 
 
 		 86 aa  166  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  81.4 
 
 		 86 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  81.4 
 
 		 86 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  81.4 
 
 		 86 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2800  ribosomal protein S20  75.58 
 
 		 86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.207865  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  77.91 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  77.91 
 
 		 88 aa  123  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  75.58 
 
 		 86 aa  121  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  74.42 
 
 		 86 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1889  30S ribosomal protein S20  73.75 
 
 		 86 aa  117  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1207  ribosomal protein S20  73.26 
 
 		 86 aa  117  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.872926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  77.5 
 
 		 88 aa  117  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  77.5 
 
 		 88 aa  116  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  71.25 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2281  30S ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218498  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  107  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12640  SSU ribosomal protein S20P  74.42 
 
 		 86 aa  107  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.464272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  70.89 
 
 		 95 aa  106  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  71.25 
 
 		 90 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  67.5 
 
 		 107 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 86 aa  104  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  65.12 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2207  ribosomal protein S20  68.6 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.437419  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  65.12 
 
 		 92 aa  100  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  63.95 
 
 		 86 aa  98.6  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 86 aa  97.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 86 aa  97.4  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0776  SSU ribosomal protein S20P  67.53 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.38047  normal  0.149543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  63.75 
 
 		 88 aa  95.5  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  66.25 
 
 		 86 aa  94.4  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  62.5 
 
 		 88 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2242  30S ribosomal protein S20  66.28 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.636504  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  65.33 
 
 		 86 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0854  ribosomal protein S20  60.47 
 
 		 86 aa  90.5  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10270  ribosomal protein S20  58.23 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0802  ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 87 aa  82.4  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.939654  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 89 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  52.33 
 
 		 89 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1614  ribosomal protein S20  63.75 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12430  SSU ribosomal protein S20P  62.79 
 
 		 88 aa  79  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0372924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  52.38 
 
 		 85 aa  77  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1654  ribosomal protein S20  60.24 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.158748  hitchhiker  0.00316633 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0583  30S ribosomal protein S20  59.3 
 
 		 86 aa  76.6  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  52.38 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 87 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  51.19 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 85 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07740  ribosomal protein S20  59.49 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.603346 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  47.06 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  47.67 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  48.84 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0416  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  63.9  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000443906  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  43.02 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  50.68 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  50.68 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  46.75 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1979  ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176977  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3203  30S ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2575  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2470  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0125567 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1939  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2600  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2551  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 90 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0950  30S ribosomal protein S20  45 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0608659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4315  30S ribosomal protein S20  49.35 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1037  ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1172  30S ribosomal protein S20  51.95 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000575412  hitchhiker  0.00000000402538 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12880  ribosomal protein S20  41.86 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.40535e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  43.02 
 
 		 86 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>