More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3157 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  100 
 
 
490 aa  958  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  64.34 
 
 
436 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  64.34 
 
 
436 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  64.34 
 
 
436 aa  531  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  66.9 
 
 
432 aa  526  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  61.89 
 
 
435 aa  521  1e-146  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  65.19 
 
 
432 aa  510  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  61.24 
 
 
437 aa  495  1e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  55.05 
 
 
461 aa  448  1e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  53.07 
 
 
430 aa  430  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  55.66 
 
 
435 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  55.93 
 
 
464 aa  421  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  55.93 
 
 
464 aa  416  1e-115  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  55.83 
 
 
457 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  55.45 
 
 
537 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  53.22 
 
 
442 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  53.22 
 
 
426 aa  389  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  53.54 
 
 
483 aa  384  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  51.28 
 
 
434 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  51.18 
 
 
425 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  50.81 
 
 
452 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  48.91 
 
 
454 aa  363  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  48.49 
 
 
439 aa  345  1e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  51.36 
 
 
484 aa  343  5e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  48.9 
 
 
438 aa  339  7e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  44.36 
 
 
495 aa  325  8e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  45.6 
 
 
465 aa  313  3e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  44.41 
 
 
443 aa  286  4e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.0224e-07 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  40.55 
 
 
447 aa  259  8e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  42.31 
 
 
448 aa  253  5e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  40 
 
 
456 aa  253  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  41.81 
 
 
444 aa  237  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  30.94 
 
 
420 aa  216  9e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  33.62 
 
 
477 aa  214  3e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  32.87 
 
 
434 aa  210  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  35.08 
 
 
447 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  42.31 
 
 
284 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  43.64 
 
 
476 aa  206  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  40.82 
 
 
499 aa  204  4e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  27.78 
 
 
422 aa  203  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  8.39014e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  31.28 
 
 
429 aa  201  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  28.71 
 
 
424 aa  201  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  37.74 
 
 
441 aa  199  6e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  41.24 
 
 
439 aa  199  1e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  28.71 
 
 
424 aa  198  2e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  32.81 
 
 
421 aa  195  2e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  35.75 
 
 
441 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  34.97 
 
 
420 aa  194  4e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  28.71 
 
 
424 aa  194  4e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  39.73 
 
 
435 aa  193  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  35.28 
 
 
442 aa  193  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  41.8 
 
 
284 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.39521e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  33.16 
 
 
428 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  38.68 
 
 
276 aa  186  7e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  35.71 
 
 
445 aa  186  1e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  37.94 
 
 
281 aa  185  2e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  30.05 
 
 
417 aa  185  2e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.93587e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  30.65 
 
 
425 aa  184  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  38.08 
 
 
421 aa  184  4e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  29.91 
 
 
447 aa  184  5e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  30.35 
 
 
421 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  30.35 
 
 
421 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  39.04 
 
 
296 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  41.88 
 
 
287 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  40.47 
 
 
287 aa  181  3e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  44.25 
 
 
250 aa  180  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  33 
 
 
430 aa  181  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  29.9 
 
 
446 aa  180  5e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  41.1 
 
 
279 aa  180  6e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  26.61 
 
 
455 aa  179  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  1.79952e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  31.48 
 
 
420 aa  179  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  30.33 
 
 
432 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  42.56 
 
 
295 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  42.56 
 
 
295 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  41.1 
 
 
279 aa  178  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  42.04 
 
 
295 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  42.04 
 
 
295 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.31 
 
 
403 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  42.56 
 
 
295 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  42.74 
 
 
279 aa  178  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.31 
 
 
295 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  33.42 
 
 
426 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.31 
 
 
295 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  41.73 
 
 
295 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.31 
 
 
295 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.31 
 
 
295 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.31 
 
 
295 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.31 
 
 
295 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  41.1 
 
 
279 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  41.1 
 
 
279 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  42.56 
 
 
295 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  28.99 
 
 
423 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  41.1 
 
 
279 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  29.82 
 
 
429 aa  177  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 
444 aa  177  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  41.1 
 
 
279 aa  177  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.93 
 
 
295 aa  176  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  37.68 
 
 
285 aa  175  1e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  28.95 
 
 
442 aa  175  2e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  40.17 
 
 
291 aa  175  2e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>