62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3136 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3136  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  777    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4288  protein of unknown function DUF222  98.44 
 
 		 524 aa  627  1e-179  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.429378  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4824  protein of unknown function DUF222  51.43 
 
 		 553 aa  333  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2802  protein of unknown function DUF222  50.5 
 
 		 551 aa  310  2e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0845411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4191  protein of unknown function DUF222  45.28 
 
 		 533 aa  242  9e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.650463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0796  protein of unknown function DUF222  45.28 
 
 		 534 aa  241  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3811  protein of unknown function DUF222  45.28 
 
 		 593 aa  239  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4658  hypothetical protein  43.78 
 
 		 275 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449109  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1835  hypothetical protein  33.44 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2470  protein of unknown function DUF222  32.11 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3745  protein of unknown function DUF222  34.52 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4127  protein of unknown function DUF222  33.73 
 
 		 532 aa  126  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3231  hypothetical protein  33.99 
 
 		 510 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4351  hypothetical protein  32.44 
 
 		 507 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4437  hypothetical protein  32.44 
 
 		 507 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.835135  normal  0.189151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11151  hypothetical protein  40.48 
 
 		 451 aa  124  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5741  hypothetical protein  32.44 
 
 		 519 aa  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.316715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5865  hypothetical protein  32.67 
 
 		 511 aa  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.563621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1777  hypothetical protein  31.77 
 
 		 507 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4731  hypothetical protein  32.44 
 
 		 507 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1709  hypothetical protein  31.77 
 
 		 507 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4912  hypothetical protein  33.66 
 
 		 508 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.477526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1730  hypothetical protein  31.77 
 
 		 507 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3477  hypothetical protein  32.44 
 
 		 506 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.800826  normal  0.648899 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5454  hypothetical protein  32.11 
 
 		 519 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.157039  decreased coverage  0.0069948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4827  hypothetical protein  33.33 
 
 		 508 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.79889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5363  hypothetical protein  32.11 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2293  protein of unknown function DUF222  31.25 
 
 		 540 aa  119  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4397  hypothetical protein  32.32 
 
 		 501 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3484  hypothetical protein  31.19 
 
 		 552 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.210016  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4232  hypothetical protein  31.5 
 
 		 448 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.815534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4610  hypothetical protein  31.1 
 
 		 448 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3379  hypothetical protein  30.42 
 
 		 497 aa  106  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.887374  normal  0.158077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3803  hypothetical protein  30.71 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.866819  normal  0.47715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11173  hypothetical protein  36.44 
 
 		 499 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4014  hypothetical protein  32.13 
 
 		 464 aa  105  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00728967 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11717  hypothetical protein  37.09 
 
 		 454 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.12455 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10095  hypothetical protein  45.91 
 
 		 317 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2089  hypothetical protein  29.32 
 
 		 493 aa  103  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3050  hypothetical protein  27.81 
 
 		 495 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3851  hypothetical protein  28.23 
 
 		 513 aa  100  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.432378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4451  hypothetical protein  27.93 
 
 		 518 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2779  hypothetical protein  32.06 
 
 		 473 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3542  hypothetical protein  29.84 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3615  hypothetical protein  29.84 
 
 		 444 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0338  hypothetical protein  29.44 
 
 		 492 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0348  hypothetical protein  29.44 
 
 		 492 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2106  hypothetical protein  29.44 
 
 		 446 aa  96.7  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.426457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2152  hypothetical protein  29.44 
 
 		 492 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.166446 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0170  hypothetical protein  28.63 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.523196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0179  hypothetical protein  28.63 
 
 		 442 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0327  hypothetical protein  29.44 
 
 		 490 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11974  hypothetical protein  36 
 
 		 454 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3547  hypothetical protein  28.63 
 
 		 444 aa  94  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2793  hypothetical protein  29.44 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.925956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2749  hypothetical protein  29.44 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.621595  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13504  hypothetical protein  50.6 
 
 		 239 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11604  REP13E12 repeat-containing protein  50.6 
 
 		 240 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.81222e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  29.67 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  27.19 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  25.56 
 
 		 546 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  23.24 
 
 		 561 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>