More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3104 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3104  Serine/threonine protein kinase-related protein  100 
 
 
659 aa  1310    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.96028  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1582  Serine/threonine protein kinase-related protein  43.66 
 
 
527 aa  310  6.999999999999999e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.278866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2026  protein kinase  55.76 
 
 
561 aa  307  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.399882  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3106  Serine/threonine protein kinase-related protein  54.57 
 
 
518 aa  306  8.000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.828958  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11292  transmembrane serine/threonine-protein kinase H pknH  45.41 
 
 
626 aa  299  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000374937  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4693  protein kinase  52.78 
 
 
574 aa  291  3e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5210  protein kinase  53.96 
 
 
484 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.706385  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  44.97 
 
 
664 aa  280  5e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1066  protein kinase  55.39 
 
 
486 aa  279  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  48.56 
 
 
1358 aa  277  5e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5408  serine/threonine protein kinase  54.94 
 
 
622 aa  274  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212471  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2534  serine/threonine protein kinase  53.85 
 
 
530 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.928543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  50 
 
 
566 aa  270  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  49.06 
 
 
583 aa  263  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3400  serine/threonine protein kinase  55.73 
 
 
522 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3463  protein kinase  55.73 
 
 
522 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0363324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3411  protein kinase  55.73 
 
 
522 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778072  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6707  serine/threonine kinase protein  53.12 
 
 
1108 aa  258  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.54449  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  48.68 
 
 
586 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4240  serine/threonine protein kinase  49.82 
 
 
541 aa  249  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.271806  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0782  serine/threonine protein kinase  50.8 
 
 
604 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0797  protein kinase  50.8 
 
 
604 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0854575 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0778  protein kinase  50.8 
 
 
604 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  42.93 
 
 
776 aa  244  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  45.04 
 
 
618 aa  215  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0441  serine/threonine protein kinase  43.7 
 
 
444 aa  212  2e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0406946  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2621  serine/threonine protein kinase  38.68 
 
 
419 aa  211  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.576747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7168  serine/threonine protein kinase  44.14 
 
 
349 aa  210  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.644589  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  41.4 
 
 
863 aa  210  8e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  45.1 
 
 
666 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34440  protein kinase family protein  40.43 
 
 
519 aa  205  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.919074 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  44.27 
 
 
571 aa  201  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4317  serine/threonine protein kinase  44.53 
 
 
587 aa  200  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4403  protein kinase  44.53 
 
 
587 aa  200  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.41 
 
 
916 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  42.86 
 
 
599 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4697  protein kinase  44.16 
 
 
587 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5401  protein kinase  41.01 
 
 
406 aa  198  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.221453  normal  0.223207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.23 
 
 
880 aa  197  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  40.82 
 
 
646 aa  196  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2487  serine/threonine protein kinase  44.19 
 
 
377 aa  195  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000035224  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  38.63 
 
 
634 aa  194  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
894 aa  193  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5859  serine/threonine protein kinase  41.58 
 
 
513 aa  193  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2531  Serine/threonine protein kinase-like protein  38.7 
 
 
511 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.600049  normal  0.466461 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.62 
 
 
645 aa  192  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  37.58 
 
 
612 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  43.19 
 
 
468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.15 
 
 
641 aa  191  5e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8314  putative serine/threonine protein kinase  37.8 
 
 
554 aa  191  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.13 
 
 
668 aa  190  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0335  serine/threonine protein kinase  39.43 
 
 
671 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656897  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1108  Serine/threonine protein kinase-related protein  40.05 
 
 
806 aa  189  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.461598  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2937  protein kinase  41.7 
 
 
414 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0760127  normal  0.185443 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  37.54 
 
 
593 aa  189  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  39.36 
 
 
403 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5484  serine/threonine protein kinase  39.36 
 
 
403 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.403058  normal  0.388642 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5771  serine/threonine protein kinase  39.36 
 
 
405 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.427583 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5242  serine/threonine protein kinase  43.56 
 
 
581 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151896  normal  0.314771 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  37.55 
 
 
776 aa  187  5e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5526  serine/threonine protein kinase  43.13 
 
 
576 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.539423 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5928  protein kinase  43.13 
 
 
576 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.94 
 
 
667 aa  187  6e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5007  serine/threonine protein kinase  42.91 
 
 
430 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0107598  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5095  serine/threonine protein kinase  42.91 
 
 
430 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0903358  normal  0.72851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1394  serine/threonine protein kinase  40.82 
 
 
790 aa  187  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0641845  normal  0.195915 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5388  serine/threonine protein kinase  42.91 
 
 
431 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0418961  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  37.54 
 
 
647 aa  186  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 
915 aa  186  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  37.08 
 
 
638 aa  186  9e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  36.72 
 
 
692 aa  186  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.03 
 
 
676 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.23 
 
 
520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  36.39 
 
 
736 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2907  serine/threonine protein kinase  41.31 
 
 
414 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2951  protein kinase  41.31 
 
 
414 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426406  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.57 
 
 
598 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.7 
 
 
658 aa  185  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.15 
 
 
584 aa  184  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  37.65 
 
 
673 aa  185  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1389  protein kinase  41.2 
 
 
412 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00892717  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  37.97 
 
 
888 aa  184  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2132  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.39 
 
 
499 aa  183  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0346111  normal  0.376131 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  36.33 
 
 
651 aa  183  8.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  39.15 
 
 
602 aa  183  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12123  transmembrane serine/threonine-protein kinase J pknJ  37.92 
 
 
589 aa  183  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0224799  normal  0.854648 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2149  serine/threonine protein kinase  41.42 
 
 
480 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  39.05 
 
 
620 aa  182  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3745  Serine/threonine protein kinase-related protein  36.36 
 
 
438 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  37.84 
 
 
614 aa  183  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  38.55 
 
 
604 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  42.02 
 
 
569 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0794  serine/threonine protein kinase  41.85 
 
 
623 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.779291  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0809  protein kinase  41.85 
 
 
623 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.386876  normal  0.0684467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0789  protein kinase  41.85 
 
 
621 aa  182  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1251  serine/threonine protein kinase  38.95 
 
 
568 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272131  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  38.04 
 
 
582 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  36.5 
 
 
625 aa  181  4e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3561  serine/threonine protein kinase  37.46 
 
 
585 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.326118  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>