More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3099 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3099  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 		 157 aa  326  8e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0468905  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2888  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0779863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06930  protein-tyrosine-phosphatase  53.29 
 
 		 166 aa  158  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12263  phosphotyrosine protein phosphatase ptpA  51.88 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3347  protein tyrosine phosphatase  51.27 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236586  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3409  protein tyrosine phosphatase  51.27 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198502  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3358  protein tyrosine phosphatase  51.27 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603407  normal  0.299244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3622  protein tyrosine phosphatase  47.47 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.27551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2713  protein tyrosine phosphatase  49.35 
 
 		 155 aa  147  6e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0875  protein tyrosine phosphatase  47.71 
 
 		 152 aa  132  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.897131  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4542  protein tyrosine phosphatase  49.66 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.95 
 
 		 453 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2341  protein-tyrosine-phosphatase  43.62 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0101078  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0034  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 182 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.297427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 		 152 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0115  protein tyrosine phosphatase  42.5 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3277  protein tyrosine phosphatase  43.05 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000374545  hitchhiker  0.00508467 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  39.62 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  39.74 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0776  protein tyrosine phosphatase  43.36 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.648722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0179  protein tyrosine phosphatase  41.07 
 
 		 175 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  42 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00340  protein-tyrosine-phosphatase  42.2 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.662786 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  40.4 
 
 		 160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  42.76 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  39.07 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  39.07 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3134  protein tyrosine phosphatase  43.92 
 
 		 167 aa  108  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3634  protein tyrosine phosphatase  42.58 
 
 		 183 aa  107  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0445  protein tyrosine phosphatase  40.62 
 
 		 186 aa  106  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1355  protein tyrosine phosphatase  39.04 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0078  protein tyrosine phosphatase  40.46 
 
 		 178 aa  104  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0306  protein tyrosine phosphatase  40.85 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  37.97 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3847  protein tyrosine phosphatase  42.14 
 
 		 182 aa  100  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12490  protein-tyrosine-phosphatase  40.27 
 
 		 175 aa  100  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.800681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  38.61 
 
 		 154 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0406  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  35.8 
 
 		 184 aa  98.6  3e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  38.31 
 
 		 154 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  40.13 
 
 		 163 aa  97.4  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 164 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  37.25 
 
 		 165 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4517  protein tyrosine phosphatase  36.09 
 
 		 196 aa  94.4  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.113878  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  36.25 
 
 		 165 aa  94.4  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  33.54 
 
 		 163 aa  93.6  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.16 
 
 		 164 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.16 
 
 		 164 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.16 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.16 
 
 		 164 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.16 
 
 		 159 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.16 
 
 		 164 aa  93.6  9e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  38.16 
 
 		 164 aa  93.6  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3711  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 		 187 aa  92.4  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.742197  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17781  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.54 
 
 		 157 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.214222  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  40.15 
 
 		 172 aa  92  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  35.33 
 
 		 158 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  34.18 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  38.85 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1791  protein-tyrosine-phosphatase  36.59 
 
 		 172 aa  90.9  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.568904  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5030  protein tyrosine phosphatase  37.68 
 
 		 172 aa  90.9  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  36.42 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  35.19 
 
 		 173 aa  90.5  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  34.18 
 
 		 154 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  34.18 
 
 		 154 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  34 
 
 		 165 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0882  protein tyrosine phosphatase  39.84 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  35.53 
 
 		 159 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  35.81 
 
 		 165 aa  89  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  36 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  31.93 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  33.77 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  35.76 
 
 		 175 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  34.46 
 
 		 155 aa  87  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0416  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  35.92 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18001  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  31.85 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.756832  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2721  protein-tyrosine-phosphatase (low molecular weight phosphotyrosine protein)  32.88 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0625929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02300  protein-tyrosine-phosphatase  37.18 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3233  hypothetical protein  36.18 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.712863 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  31.58 
 
 		 157 aa  85.5  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3741  protein tyrosine phosphatase  36.6 
 
 		 162 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0796965  hitchhiker  0.00000000624838 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1297  protein tyrosine phosphatase  37.69 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  34.21 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  31.17 
 
 		 162 aa  83.6  9e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  33.96 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  35.33 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0736  protein tyrosine phosphatase  38.41 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0397767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  32.89 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  35.81 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1114  protein tyrosine phosphatase  33.33 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000797417  unclonable  0.0000000387087 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17831  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  30.26 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.321428  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  36 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0393  protein tyrosine phosphatase  35.38 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3410  protein tyrosine phosphatase  30.87 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4481  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.14 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.18 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  33.99 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  31.58 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>