More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3049 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  100 
 
 		 347 aa  694    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  49.35 
 
 		 348 aa  293  4e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  38.03 
 
 		 378 aa  216  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  36.34 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  36.34 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  36.73 
 
 		 378 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5385  NLP/P60 protein  38.29 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  36.07 
 
 		 372 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3713  NLP/P60 protein  38.61 
 
 		 348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5350  NLP/P60 protein  38.33 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5661  NLP/P60 protein  38.61 
 
 		 348 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2808  NLP/P60 protein  38.5 
 
 		 348 aa  210  3e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  37.91 
 
 		 370 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0888  NLP/P60 protein  40.11 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1435  NLP/P60  39.44 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0418485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1453  NLP/P60 protein  39.44 
 
 		 361 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  35.9 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4570  NLP/P60 protein  39.01 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1380  NLP/P60 protein  37.27 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1820  NLP/P60 protein  33.85 
 
 		 330 aa  157  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  35.53 
 
 		 332 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  37.76 
 
 		 446 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  33.47 
 
 		 340 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  38.56 
 
 		 335 aa  136  7.000000000000001e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  28.39 
 
 		 321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3124  NLP/P60 protein  33.44 
 
 		 327 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0606455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0243  NLP/P60 protein  29.73 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2684  NLP/P60 protein  53.21 
 
 		 232 aa  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.708971  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3050  NLP/P60 protein  54 
 
 		 227 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6766  NLP/P60 protein  27.84 
 
 		 350 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3420  NLP/P60 protein  29.8 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6095  NLP/P60 protein  31.93 
 
 		 366 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0060  NLP/P60 protein  26.89 
 
 		 337 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  29.69 
 
 		 391 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3237  NLP/P60 protein  50.96 
 
 		 380 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00058739  hitchhiker  0.000426733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0190  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  48.31 
 
 		 235 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  31.85 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4866  NLP/P60 protein  31.76 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5879  NLP/P60 protein  31.35 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884921  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  50.46 
 
 		 164 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  46.53 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0055  NLP/P60 protein  28.07 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.275537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6205  NLP/P60 protein  31.4 
 
 		 417 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0502801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0917  NLP/P60 protein  43.8 
 
 		 173 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.693605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3144  NLP/P60 protein  27.69 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0327841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5880  NLP/P60 protein  49.49 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.791829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  29.6 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1508  NLP/P60 protein  26.84 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  44.83 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0423  NLP/P60  48.98 
 
 		 459 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  47.27 
 
 		 329 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1348  NLP/P60 protein  40.44 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00998708  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4498  NLP/P60 protein  47.66 
 
 		 398 aa  103  6e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.0701003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  48 
 
 		 162 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.83 
 
 		 222 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  44.76 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3579  NLP/P60 protein  30.61 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  30.42 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  51.58 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  44.63 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  43.8 
 
 		 432 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0971  NLP/P60 protein  46.81 
 
 		 345 aa  96.7  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.230256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  43.64 
 
 		 333 aa  95.9  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  42.74 
 
 		 476 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1461  NLP/P60  46.9 
 
 		 366 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495869  decreased coverage  0.00837381 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2136  NLP/P60 protein  50.54 
 
 		 389 aa  95.1  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000118144  normal  0.895402 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0385  NLP/P60 protein  31.16 
 
 		 360 aa  95.1  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5004  NLP/P60 protein  44.25 
 
 		 347 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.549544  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  43.64 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  43.64 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0694  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 453 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.427421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3453  NLP/P60 protein  40.54 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  43.64 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  43.64 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  43.69 
 
 		 452 aa  94  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  43 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  43.64 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8562  NLP/P60 protein  29 
 
 		 373 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0614213  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1303  NLP/P60 protein  33.04 
 
 		 319 aa  93.6  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0103745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1427  NLP/P60 protein  46.3 
 
 		 301 aa  93.2  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2897  NLP/P60 family protein  43.64 
 
 		 333 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4506  NLP/P60 protein  43.1 
 
 		 501 aa  92.8  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.918319  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2432  NLP/P60 family protein  39.06 
 
 		 333 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.899635 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  46 
 
 		 370 aa  92  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4086  NLP/P60 protein  42.5 
 
 		 517 aa  92  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.296945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2686  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29.79 
 
 		 330 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377535  normal  0.257604 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  40.48 
 
 		 217 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4013  NLP/P60 protein  48.96 
 
 		 236 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13280  NlpC/P60 family protein  30.99 
 
 		 371 aa  91.3  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.401944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3958  NLP/P60 protein  31.22 
 
 		 323 aa  90.5  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.068937  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2878  NLP/P60 family protein  42.73 
 
 		 333 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0584446  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  43.62 
 
 		 400 aa  90.1  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2651  NLP/P60 protein  41.82 
 
 		 333 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0570  NLP/P60 protein  45 
 
 		 160 aa  89.4  8e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4511  NLP/P60 protein  27.76 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307006  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0285  NLP/P60  47.19 
 
 		 368 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4593  NLP/P60 protein  43.33 
 
 		 269 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00530725  hitchhiker  0.00160562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  39.47 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  41.82 
 
 		 333 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>