197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2977 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4330  acyltransferase 3  51.77 
 
 
711 aa  679    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2977  acyltransferase 3  100 
 
 
751 aa  1518    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2821  acyltransferase 3  44.86 
 
 
728 aa  575  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5673  acyltransferase 3  44.83 
 
 
728 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  0.411355 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3701  acyltransferase 3  44.83 
 
 
728 aa  561  1e-158  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.332374  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5338  acyltransferase 3  44.83 
 
 
728 aa  561  1e-158  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2787  acyltransferase 3  45.25 
 
 
731 aa  551  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11597  hypothetical protein  43.43 
 
 
729 aa  547  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3079  acyltransferase 3  43.84 
 
 
716 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3139  acyltransferase 3  43.84 
 
 
716 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3096  acyltransferase 3  43.84 
 
 
716 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140051  normal  0.0654687 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3630  acyltransferase 3  44.14 
 
 
731 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3862  acyltransferase 3  45.12 
 
 
694 aa  522  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.354687  normal  0.0930515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23340  predicted acyltransferase  32.97 
 
 
690 aa  324  4e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.196361  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2135  acyltransferase 3  34.35 
 
 
646 aa  321  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0620882  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0643  acyltransferase 3  34.09 
 
 
693 aa  321  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21020  predicted acyltransferase  30.96 
 
 
676 aa  309  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00110133  normal  0.49378 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3768  acyltransferase 3  32.5 
 
 
675 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0162791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1170  acyltransferase 3  34.25 
 
 
694 aa  298  3e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.177695  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2880  acyltransferase 3  31.22 
 
 
681 aa  295  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.985615  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2588  acyltransferase 3  31.43 
 
 
681 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000354486 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  30.68 
 
 
715 aa  283  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5324  acyltransferase 3  31.22 
 
 
675 aa  282  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.778856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2881  acyltransferase 3  29.2 
 
 
684 aa  282  2e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16522  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2589  acyltransferase 3  30.49 
 
 
696 aa  279  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000104054 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  30.74 
 
 
690 aa  261  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  29.76 
 
 
777 aa  261  5.0000000000000005e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4381  acyltransferase 3  30.47 
 
 
687 aa  259  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.106108  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3189  acyltransferase 3  28.89 
 
 
688 aa  256  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  27.49 
 
 
675 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26710  predicted acyltransferase  29.93 
 
 
691 aa  239  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  30.79 
 
 
685 aa  237  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  27.98 
 
 
711 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  28.63 
 
 
675 aa  235  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  29.26 
 
 
716 aa  229  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  27.99 
 
 
718 aa  211  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  28.55 
 
 
679 aa  210  9e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  28.66 
 
 
742 aa  209  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26820  predicted acyltransferase  27.37 
 
 
720 aa  201  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  27.88 
 
 
710 aa  197  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  27.88 
 
 
710 aa  197  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6545  acyltransferase 3  28.28 
 
 
675 aa  190  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26680  predicted acyltransferase  28.03 
 
 
858 aa  189  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0131  acyltransferase 3  28.11 
 
 
726 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.971187  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0140  acyltransferase 3  28.11 
 
 
726 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.939637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0121  acyltransferase 3  28.11 
 
 
726 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.695544  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3258  acyltransferase 3  27.65 
 
 
725 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.575556  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14070  predicted acyltransferase  27.53 
 
 
722 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.276314  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  27.09 
 
 
681 aa  171  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  26.06 
 
 
682 aa  154  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  27.04 
 
 
660 aa  151  5e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  24.93 
 
 
695 aa  150  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08780  predicted acyltransferase  30.3 
 
 
777 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292028  normal  0.139471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2687  acyltransferase 3  24.97 
 
 
734 aa  143  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  27.03 
 
 
651 aa  142  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4448  acyltransferase 3  25.23 
 
 
679 aa  140  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00871902  normal  0.076246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  25 
 
 
690 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  25.29 
 
 
684 aa  134  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0464  acyltransferase 3  27.3 
 
 
660 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.804151  normal  0.342656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  24.8 
 
 
635 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  31.16 
 
 
629 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2692  acyltransferase domain-containing protein  31.16 
 
 
647 aa  128  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  32.47 
 
 
662 aa  125  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  31.01 
 
 
695 aa  124  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  25.84 
 
 
656 aa  124  8e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  30.38 
 
 
662 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0435  acyltransferase 3  28.8 
 
 
679 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.81712 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  26.01 
 
 
695 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1872  acyltransferase 3  31.41 
 
 
629 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4779  acyltransferase 3  28.4 
 
 
428 aa  120  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0265  acyltransferase 3  26.37 
 
 
645 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.796474  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1772  acyltransferase 3  28 
 
 
683 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415848  normal  0.0191672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1909  acyltransferase 3  29.97 
 
 
675 aa  119  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  24.73 
 
 
660 aa  116  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  28.41 
 
 
640 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  28.24 
 
 
637 aa  116  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69170  putative O-antigen acetylase  32.91 
 
 
662 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  28 
 
 
657 aa  114  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  28 
 
 
657 aa  113  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  27.34 
 
 
643 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6674  acyltransferase 3  30.84 
 
 
720 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  26.85 
 
 
671 aa  111  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  28.17 
 
 
632 aa  111  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2505  acyltransferase 3  30.1 
 
 
665 aa  110  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354964  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  29.76 
 
 
660 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  29.46 
 
 
759 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  25.4 
 
 
665 aa  110  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  26.92 
 
 
690 aa  109  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  24.74 
 
 
660 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  28.35 
 
 
634 aa  108  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  27.74 
 
 
673 aa  107  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.91 
 
 
616 aa  107  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  28.14 
 
 
656 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1117  acyltransferase 3  27.51 
 
 
645 aa  105  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2758  O-antigen acetylase  27.38 
 
 
691 aa  105  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05637  acyltransferase  26.61 
 
 
615 aa  103  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  29.62 
 
 
671 aa  103  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0976  acyltransferase 3  25.8 
 
 
402 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.207493  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05810  predicted acyltransferase  28.77 
 
 
705 aa  101  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.550505  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02452  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  23.4 
 
 
639 aa  101  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.102125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>