More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2923 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2923  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  100 
 
 		 287 aa  567  1e-161  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5672  alpha/beta hydrolase fold protein  46.59 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  45.39 
 
 		 280 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.904982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2003  alpha/beta hydrolase fold protein  42.7 
 
 		 288 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0706427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3765  alpha/beta hydrolase fold protein  40.58 
 
 		 285 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00546797  normal  0.0830627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5684  alpha/beta hydrolase fold  41.45 
 
 		 274 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5859  alpha/beta hydrolase fold  42.55 
 
 		 274 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5394  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 		 274 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.117784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5305  alpha/beta hydrolase fold  41.09 
 
 		 274 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640816  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3236  alpha/beta hydrolase fold  40.86 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.21765  normal  0.676167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5694  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 		 285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0242785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1124  hydrolase/oxidase  30.97 
 
 		 292 aa  138  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5169  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5258  alpha/beta hydrolase fold  33.7 
 
 		 281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5550  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 281 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10077  oxidoreductase  31.88 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0857  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.26 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00184237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4132  alpha/beta hydrolase fold  31.64 
 
 		 280 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.555092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.09 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 246 aa  69.3  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  23.1 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  27.64 
 
 		 350 aa  68.9  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  23.05 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 		 271 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  27.42 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  24.37 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5931  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0123978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  22.01 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  25.96 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  27.73 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  26.67 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  23.51 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  36.73 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  25.47 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  23.62 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  25.96 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1047  alpha/beta hydrolase fold protein  23.53 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  25.7 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  26.15 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27.04 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  24.1 
 
 		 295 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02370  non-heme chloroperoxidase (abhydrolase_1 family)  25.59 
 
 		 274 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.165493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  34.85 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  22.84 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  23.69 
 
 		 339 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  32.17 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  33.53 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  23.88 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  28.72 
 
 		 251 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.41 
 
 		 372 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  22.81 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3383  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  25.13 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  32.38 
 
 		 258 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  20.28 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  26.2 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  25.13 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1735  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1589  alpha/beta hydrolase fold  24.39 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000678244  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  20.93 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6134  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4924  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3020  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.702014  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4694  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5346  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00669533  normal  0.437988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0304  Alpha/beta hydrolase  34.07 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0843  Alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 350 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  34.26 
 
 		 296 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5225  alpha/beta hydrolase fold  34.07 
 
 		 283 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  24.65 
 
 		 262 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  23.53 
 
 		 341 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  34.88 
 
 		 340 aa  52.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 		 298 aa  52.8  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  23.16 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 296 aa  52.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>