More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2862 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  100 
 
 
229 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  44.71 
 
 
228 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6620  transcriptional regulator, GntR family  42.86 
 
 
207 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0364591  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 
227 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  37.27 
 
 
233 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 
234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 
233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 
231 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0179  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 
214 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 
218 aa  118  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 
220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  35.55 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  37.32 
 
 
219 aa  115  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
232 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8629  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
229 aa  111  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 
225 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
231 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 
237 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 
239 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 
231 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1044  transcriptional regulator  34.22 
 
 
234 aa  107  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000547437  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 
232 aa  105  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 
223 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  38.59 
 
 
221 aa  105  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1700  GntR-like protein  35.22 
 
 
164 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000000597096  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 
226 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
229 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 
233 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 
235 aa  102  6e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
232 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 
229 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 
229 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
248 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
234 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 
239 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 
230 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
230 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
262 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 
219 aa  99.4  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
243 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  32.84 
 
 
224 aa  98.2  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 
219 aa  98.2  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  45.8 
 
 
269 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 
221 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 
235 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 
221 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
219 aa  96.7  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 
242 aa  95.9  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 
230 aa  96.3  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 
227 aa  95.9  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
262 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
262 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
226 aa  95.9  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
224 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
234 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 
228 aa  95.1  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 
223 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  36.95 
 
 
239 aa  95.1  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
241 aa  95.1  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
217 aa  95.1  8e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
219 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
219 aa  95.1  9e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
229 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4175  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
241 aa  94.4  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  32.02 
 
 
226 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0081  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
247 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
230 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
227 aa  94  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 
238 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0150  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 
209 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.80263  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
255 aa  92.8  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
242 aa  91.7  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  37.75 
 
 
233 aa  91.7  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
241 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 
241 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  31.72 
 
 
254 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 
258 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  28.5 
 
 
237 aa  90.9  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.120377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>