142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2857 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  58.6 
 
 		 771 aa  761    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 788 aa  1568    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  49.94 
 
 		 748 aa  601  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  48.96 
 
 		 754 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  48.46 
 
 		 765 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.8 
 
 		 813 aa  574  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  47.04 
 
 		 746 aa  566  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  48.52 
 
 		 776 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.49 
 
 		 766 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  46.97 
 
 		 832 aa  560  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  45.76 
 
 		 795 aa  539  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  45.41 
 
 		 786 aa  528  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.81 
 
 		 804 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  42.82 
 
 		 759 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  42.92 
 
 		 902 aa  517  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  42.55 
 
 		 741 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  44.97 
 
 		 726 aa  501  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.41 
 
 		 757 aa  491  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  40.46 
 
 		 742 aa  484  1e-135  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  40.49 
 
 		 742 aa  481  1e-134  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.6 
 
 		 733 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  42.21 
 
 		 735 aa  464  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  40.43 
 
 		 759 aa  460  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  41.18 
 
 		 734 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.67 
 
 		 767 aa  455  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  42.61 
 
 		 758 aa  453  1.0000000000000001e-126  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  40.4 
 
 		 829 aa  450  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.51 
 
 		 732 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  41.15 
 
 		 724 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  41.15 
 
 		 724 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  41.03 
 
 		 724 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1575  UvrD/REP helicase  45.37 
 
 		 750 aa  449  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0191582 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.08 
 
 		 747 aa  445  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  37.59 
 
 		 758 aa  439  9.999999999999999e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  41.27 
 
 		 874 aa  438  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.78 
 
 		 685 aa  439  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.17 
 
 		 693 aa  338  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.98 
 
 		 691 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  34.69 
 
 		 703 aa  303  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  34.77 
 
 		 705 aa  289  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  34.11 
 
 		 761 aa  277  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  31.59 
 
 		 799 aa  276  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  30.86 
 
 		 742 aa  272  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  34.16 
 
 		 726 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.67 
 
 		 764 aa  266  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  32.25 
 
 		 717 aa  266  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.99 
 
 		 715 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  32.48 
 
 		 716 aa  262  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  30.42 
 
 		 715 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  30.88 
 
 		 732 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  40.73 
 
 		 706 aa  240  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  36.03 
 
 		 706 aa  237  6e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3495  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.8 
 
 		 728 aa  229  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.471615  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.88 
 
 		 755 aa  229  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  37.05 
 
 		 724 aa  226  9e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  33.38 
 
 		 710 aa  224  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  32.77 
 
 		 680 aa  216  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  35.93 
 
 		 666 aa  211  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  30.94 
 
 		 719 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.82 
 
 		 705 aa  208  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.54 
 
 		 670 aa  190  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  37.41 
 
 		 695 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.99 
 
 		 659 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.59 
 
 		 672 aa  181  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.62 
 
 		 695 aa  180  7e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  33.01 
 
 		 692 aa  178  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  32.43 
 
 		 684 aa  172  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.19 
 
 		 645 aa  172  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  32.09 
 
 		 727 aa  168  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  33.04 
 
 		 679 aa  167  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  33.26 
 
 		 792 aa  164  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  32.86 
 
 		 717 aa  163  1e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.49 
 
 		 710 aa  163  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  28.94 
 
 		 1048 aa  120  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  34.48 
 
 		 691 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  33.91 
 
 		 706 aa  117  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  33.91 
 
 		 706 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  34.93 
 
 		 689 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  35.19 
 
 		 689 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  35.19 
 
 		 689 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  35.19 
 
 		 689 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  34.5 
 
 		 689 aa  116  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1990  UvrD/REP helicase  33.05 
 
 		 780 aa  115  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.486278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  36.23 
 
 		 689 aa  115  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  34.5 
 
 		 691 aa  115  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.74 
 
 		 763 aa  114  7.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.74 
 
 		 763 aa  114  9e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  34.06 
 
 		 691 aa  114  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  34.06 
 
 		 689 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  36.24 
 
 		 753 aa  112  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  28.25 
 
 		 861 aa  111  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  32.14 
 
 		 702 aa  108  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.41 
 
 		 772 aa  108  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  23.33 
 
 		 762 aa  107  1e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  32.86 
 
 		 702 aa  107  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  37.63 
 
 		 785 aa  105  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  30.04 
 
 		 787 aa  105  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  27.97 
 
 		 764 aa  104  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0956  UvrD/REP helicase  34.83 
 
 		 778 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161891  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1625  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  29.37 
 
 		 768 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>