More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2770 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2770  regulatory protein MerR  100 
 
 		 142 aa  284  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3639  putative transcriptional regulator, MerR family  50.74 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1516  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 201 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.699928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2312  putative transcriptional regulator, MerR family  41.98 
 
 		 198 aa  93.6  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  40.68 
 
 		 491 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 198 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 164 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 164 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 164 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 164 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 255 aa  90.1  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  45.22 
 
 		 449 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 190 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0435  putative transcriptional regulator, MerR family  40.31 
 
 		 165 aa  87.8  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.517587  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 153 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2189  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0528  transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.878422 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5353  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.657769  normal  0.551458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7947  putative transcriptional regulator, MerR family  38.6 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5145  MerR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130507  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 138 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  39.32 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0886  mercuric resistance operon regulatory protein  31.93 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1435  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0777608  normal  0.768186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3633  transcriptional regulator, MerR family  39.67 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4935  MerR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327998  normal  0.0174485 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4449  mercuric resistance operon regulatory protein  31.93 
 
 		 119 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00937003  normal  0.868186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7602  putative transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.621201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3555  MerR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0311437  normal  0.0197262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0743  MerR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3322  regulatory protein, MerR  39.83 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1799  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.21338  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  33.6 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  41.41 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  36.13 
 
 		 160 aa  73.6  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0923  MerR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1484  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02350  transcriptional regulator, MerR family  34.75 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0160379  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0082  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3285  transcriptional regulator, MerR family  38.26 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200558  normal  0.212235 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1968  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 151 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.631262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1560  transcriptional regulator, MerR family  28 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000421328  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18180  predicted transcriptional regulator  34.51 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.575083  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0082  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3872  transcriptional regulator, MerR family protein  35.29 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2478  transcriptional regulator, MerR family  45.95 
 
 		 185 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.263723 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0088  MerR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 118 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2084  transcriptional regulator, MerR family  45.95 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0438  transcriptional regulator, MerR family  31.85 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  35.43 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1384  regulatory protein, MerR  39.06 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4570  regulatory protein MerR  36.28 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.922627  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1810  transcriptional regulator, MerR family  27.97 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.145688  normal  0.140149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6425  transcriptional regulator, MerR family  33.07 
 
 		 131 aa  67  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1570  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4827  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  27.61 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0088  MerR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0626  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 115 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl251  MerR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000105491  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  30.58 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1547  MerR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148728  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4050  MerR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 144 aa  63.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2652  transcriptional regulator, MerR family  38.02 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  28.46 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1362  transcriptional regulator  27.87 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.270977  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00910  predicted transcriptional regulator  26.45 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.975213  normal  0.42644 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3138  MerR family transcriptional regulator  31 
 
 		 117 aa  60.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.267666  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl171  MerR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0487  transcriptional regulator, MerR family  27.19 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.452136  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0079  transcriptional regulator  29.9 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2820  MerR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.218132  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1034  SoxR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  36.63 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0702  transcriptional regulator  26.85 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.271355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3223  transcriptional regulator, MerR family  26.5 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0351444  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4563  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1817  transcriptional regulator, MerR family  24.39 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 		 169 aa  53.5  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  29.23 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0461  MerR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 174 aa  53.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0313707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>