More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2693 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  100 
 
 		 192 aa  374  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  45.6 
 
 		 192 aa  124  9e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  42.53 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  48.12 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  36.42 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 211 aa  91.3  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  33.86 
 
 		 201 aa  89  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  31.61 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  31.25 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 261 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  30.49 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  30.92 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 234 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  27.75 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.73 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.73 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.73 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.73 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.73 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.07 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.97 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  35.45 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  30.91 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  30.91 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.91 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.91 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.91 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.91 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.91 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.91 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  48.39 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.28 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  33.66 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  37.36 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  43.02 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.55 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>