12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2676 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2676  helicase-associated  100 
 
 
222 aa  445  1.0000000000000001e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00131855  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2675  helicase-associated  73.1 
 
 
153 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00741128  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  35.2 
 
 
871 aa  93.2  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  27.54 
 
 
1004 aa  63.9  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  21.74 
 
 
977 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43867  predicted protein  24.31 
 
 
485 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0425641  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6930  helicase-associated  36.05 
 
 
118 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.945725  normal  0.198271 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  24 
 
 
1341 aa  45.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43902  predicted protein  27.34 
 
 
1416 aa  45.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.279249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0998  helicase-associated  31.19 
 
 
235 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_6725  predicted protein  31.19 
 
 
168 aa  42  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4408  helicase-associated  24.3 
 
 
302 aa  42  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>