16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2647 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2647  Alkylmercury lyase  100 
 
 
213 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25630  alkylmercury lyase  46.63 
 
 
227 aa  152  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4512  alkylmercury lyase  45.51 
 
 
221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0148177 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3214  alkylmercury lyase  42 
 
 
213 aa  141  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00854121  normal  0.424714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0243  alkylmercury lyase  38.46 
 
 
211 aa  124  8.000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02948  alkylmercury lyase  40.51 
 
 
211 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.597593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0319  alkylmercury lyase  42.51 
 
 
209 aa  122  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5374  Alkylmercury lyase  39.53 
 
 
216 aa  116  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0164  alkylmercury lyase  38.51 
 
 
212 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.581292  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2330  alkylmercury lyase  26.78 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0726495  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4942  alkylmercury lyase  27.38 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0286842  normal  0.02099 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1769  alkylmercury lyase  30.99 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1768  alkylmercury lyase  35.66 
 
 
190 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.628119  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  27.06 
 
 
600 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  28.77 
 
 
617 aa  41.6  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  26.47 
 
 
600 aa  41.6  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>