45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2570 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2570    100 
 
 		 538 bp  1066    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.45845  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04880  transposase family protein  79.33 
 
 		 1308 bp  167  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06410  transposase family protein  79.33 
 
 		 1308 bp  167  4.0000000000000004e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09110  transposase  85.8 
 
 		 1332 bp  151  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0374233  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11890  transposase  85.8 
 
 		 1332 bp  151  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.565159  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18120  transposase family protein  85.8 
 
 		 1041 bp  151  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0064535  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21140  transposase family protein  86.05 
 
 		 1353 bp  113  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23830  transposase family protein  86.05 
 
 		 1353 bp  113  5e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05280    78.45 
 
 		 1297 bp  109  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22680  transposase family protein  85.19 
 
 		 936 bp  109  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.971541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07920    78.45 
 
 		 1267 bp  109  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25640  transposase family protein  78.45 
 
 		 1329 bp  109  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05340    78.45 
 
 		 1267 bp  109  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00920    78.45 
 
 		 1261 bp  109  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0230    85.34 
 
 		 1328 bp  95.6  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0928078  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3595  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  80.3 
 
 		 1137 bp  85.7  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0104734  normal  0.17723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1262  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  91.8 
 
 		 1317 bp  81.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3311  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  91.8 
 
 		 1317 bp  81.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21460  transposase family protein  85.26 
 
 		 1308 bp  77.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  unclonable  1.3054300000000002e-18  hitchhiker  0.0000742439 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25600  transposase family protein  84.47 
 
 		 1317 bp  77.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24200  transposase family protein  85.26 
 
 		 1308 bp  77.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23600  transposase family protein  84.47 
 
 		 1317 bp  77.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.237959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02150  transposase family protein  85.26 
 
 		 1308 bp  77.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02160  transposase family protein  85.26 
 
 		 1308 bp  77.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20360  transposase  85.26 
 
 		 1308 bp  77.8  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00530  transposase  85.26 
 
 		 1308 bp  77.8  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17110  transposase family protein  85.26 
 
 		 1308 bp  77.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17100    85.26 
 
 		 2292 bp  77.8  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0207297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2083    80 
 
 		 210 bp  69.9  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.166303 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15140  transposase family protein  87.32 
 
 		 1356 bp  69.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0303728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24210    87.32 
 
 		 2767 bp  69.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22840  transposase family protein  87.32 
 
 		 1317 bp  69.9  0.0000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.546721 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06980  transposase family protein  83.17 
 
 		 1317 bp  65.9  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23480  transposase family protein  83.17 
 
 		 1317 bp  65.9  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25590    88.14 
 
 		 399 bp  61.9  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3284    86.44 
 
 		 249 bp  54  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25960  transposase family protein  79.04 
 
 		 1311 bp  54  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1245  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  88 
 
 		 1305 bp  52  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139986  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2889  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  88 
 
 		 1305 bp  52  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0124927  hitchhiker  0.00109872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3047  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  88 
 
 		 1305 bp  52  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000291896  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  88 
 
 		 1305 bp  52  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17870    100 
 
 		 1288 bp  50.1  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.471546  normal  0.683264 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17820    100 
 
 		 1289 bp  50.1  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.61942  normal  0.675195 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02610    79.84 
 
 		 396 bp  48.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22130  transposase family protein  87.23 
 
 		 1089 bp  46.1  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.900439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>