More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2545 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  100 
 
 		 536 aa  1065    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  65.09 
 
 		 548 aa  632  1e-180  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  62.83 
 
 		 532 aa  610  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  55.08 
 
 		 542 aa  533  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  56.2 
 
 		 552 aa  530  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  56.8 
 
 		 566 aa  520  1e-146  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3491  phytoene desaturase  51.12 
 
 		 551 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  45.29 
 
 		 490 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2891  phytoene desaturase  50.57 
 
 		 550 aa  413  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.101189 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  39.81 
 
 		 519 aa  365  1e-100  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  41.07 
 
 		 498 aa  361  1e-98  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  41.56 
 
 		 500 aa  349  7e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  39.4 
 
 		 499 aa  343  5e-93  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  38.48 
 
 		 527 aa  332  1e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  33.27 
 
 		 497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  37.09 
 
 		 491 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  36.94 
 
 		 490 aa  309  8e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  32.68 
 
 		 493 aa  309  8e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  38.49 
 
 		 506 aa  298  2e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  33.07 
 
 		 501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  32.76 
 
 		 488 aa  286  7e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  32.49 
 
 		 488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0318  phytoene desaturase  36.36 
 
 		 526 aa  281  2e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158779  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1073  phytoene dehydrogenase-related protein  32.54 
 
 		 460 aa  229  6e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  33.14 
 
 		 505 aa  229  8e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  33.07 
 
 		 509 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  28.9 
 
 		 502 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  28.9 
 
 		 502 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  32.11 
 
 		 492 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  31.06 
 
 		 512 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  27.01 
 
 		 537 aa  219  7.999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  31.38 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  30.87 
 
 		 512 aa  217  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  32.77 
 
 		 492 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  32.84 
 
 		 521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  32.39 
 
 		 509 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  31.76 
 
 		 507 aa  205  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  31.27 
 
 		 508 aa  204  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  33.08 
 
 		 525 aa  204  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  31.51 
 
 		 507 aa  202  9e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  30.27 
 
 		 518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  30.04 
 
 		 493 aa  200  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0409  phytoene dehydrogenase-related protein  31.45 
 
 		 465 aa  200  6e-50  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0703  phytoene desaturase  30.08 
 
 		 453 aa  200  7e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.687275  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  33.79 
 
 		 489 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  30.5 
 
 		 495 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  28.08 
 
 		 511 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  30.95 
 
 		 492 aa  197  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  28.9 
 
 		 553 aa  196  7e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  31.42 
 
 		 502 aa  196  8.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  31.58 
 
 		 530 aa  195  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  31.46 
 
 		 491 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  30.43 
 
 		 503 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  31.08 
 
 		 503 aa  194  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  26.59 
 
 		 494 aa  193  8e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  29.92 
 
 		 508 aa  192  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  30.97 
 
 		 492 aa  192  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  30.23 
 
 		 497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  28.91 
 
 		 511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  30.69 
 
 		 508 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  29.12 
 
 		 519 aa  190  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  31.33 
 
 		 504 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  31.58 
 
 		 530 aa  189  8e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  31.57 
 
 		 498 aa  189  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  26.71 
 
 		 546 aa  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  31.02 
 
 		 507 aa  187  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  31.34 
 
 		 495 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  33.46 
 
 		 494 aa  187  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  30.86 
 
 		 492 aa  186  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  32.12 
 
 		 492 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  32.95 
 
 		 506 aa  184  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  28.38 
 
 		 511 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  30.42 
 
 		 529 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  30.74 
 
 		 512 aa  184  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  29.39 
 
 		 512 aa  183  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  30.31 
 
 		 530 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  26.94 
 
 		 552 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  29.03 
 
 		 504 aa  181  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  27.52 
 
 		 553 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  30.85 
 
 		 512 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  30.85 
 
 		 512 aa  181  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  30.26 
 
 		 492 aa  181  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  34.17 
 
 		 494 aa  179  8e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  30.71 
 
 		 495 aa  179  9e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  27.96 
 
 		 511 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  30.62 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  30.04 
 
 		 508 aa  178  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  23.47 
 
 		 499 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  32.75 
 
 		 502 aa  177  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  26.16 
 
 		 549 aa  177  5e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0524  amine oxidase  28.84 
 
 		 556 aa  177  5e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.599626 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  26.56 
 
 		 497 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  26.56 
 
 		 497 aa  176  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  29.63 
 
 		 531 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  30.53 
 
 		 509 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  29.84 
 
 		 508 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  32.29 
 
 		 495 aa  171  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  26.74 
 
 		 519 aa  170  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  28.95 
 
 		 492 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  28.4 
 
 		 496 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>