More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2539 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2539  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
266 aa  535  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5431  enoyl-CoA hydratase  52.27 
 
 
280 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2637  putative enoyl-CoA hydratase  51.88 
 
 
266 aa  238  5.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_40988  enyol-coa hydratase  49.81 
 
 
356 aa  236  3e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.569479  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2926  enoyl-CoA hydratase  46.67 
 
 
269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31259  normal  0.637069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3598  enoyl-CoA hydratase  49.07 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1678  enoyl-CoA hydratase  50 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1870  enoyl-CoA hydratase  50.37 
 
 
270 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.19411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4829  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.37 
 
 
270 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3284  enoyl-CoA hydratase  48.13 
 
 
277 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2234  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.62 
 
 
275 aa  227  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0502  enoyl-CoA hydratase  51.33 
 
 
268 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1966  enoyl-CoA hydratase  48.15 
 
 
270 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.231207  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4615  enoyl-CoA hydratase  49.25 
 
 
273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4481  enoyl-CoA hydratase  49.25 
 
 
273 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.189541 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1980  enoyl-CoA hydratase  50.96 
 
 
265 aa  211  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0365  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.96 
 
 
271 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.940148  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0571  enoyl-CoA hydratase  45.12 
 
 
273 aa  204  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0223  enoyl-CoA hydratase  44.61 
 
 
267 aa  203  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0534  enoyl-CoA hydratase  45.53 
 
 
268 aa  192  6e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0572  enoyl-CoA hydratase  42.7 
 
 
268 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0572  enoyl-CoA hydratase  44.76 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1674  enoyl-CoA hydratase/isomerase  49.04 
 
 
269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.573511  normal  0.0329528 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0573  enoyl-CoA hydratase  42.7 
 
 
268 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3457  enoyl-CoA hydratase  42.32 
 
 
268 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4327  enoyl-CoA hydratase  43.41 
 
 
299 aa  187  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.164377  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3135  enoyl-CoA hydratase  44.96 
 
 
268 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3304  enoyl-CoA hydratase  44.44 
 
 
268 aa  186  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0388  enoyl-CoA hydratase  41.92 
 
 
275 aa  184  9e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165934  unclonable  0.000000000539782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0382  enoyl-CoA hydratase  40.08 
 
 
270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.012156 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0623  enoyl-CoA hydratase  44.98 
 
 
278 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3510  enoyl-CoA hydratase  43.75 
 
 
268 aa  181  1e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0454  enoyl-CoA hydratase  44.36 
 
 
269 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.500055 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3709  enoyl-CoA hydratase  43.39 
 
 
268 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0348  enoyl-CoA hydratase  39.26 
 
 
270 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0533  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 
268 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3918  enoyl-CoA hydratase  42.31 
 
 
268 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3792  enoyl-CoA hydratase  44.21 
 
 
268 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3735  enoyl-CoA hydratase  43.8 
 
 
268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1409  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.29 
 
 
263 aa  169  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1572  short chain enoyl-CoA hydratase  33.71 
 
 
259 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150745  normal  0.335046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2497  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.91 
 
 
967 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.126013  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.69 
 
 
259 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1550  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.4 
 
 
261 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3800  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
287 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.964787  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3320  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.178125  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.25 
 
 
264 aa  133  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000599217 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5145  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.27 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.149843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.16 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.51 
 
 
259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.34 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 
264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  33.57 
 
 
280 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 
260 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  33.57 
 
 
280 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2069  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 
270 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0197302  normal  0.0807955 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0122  enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 
264 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0194  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.32 
 
 
265 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0254  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.58 
 
 
262 aa  125  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.168242  normal  0.0914474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2444  enoyl-CoA hydratase  33.72 
 
 
260 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1841  enoyl-CoA hydratase  33.82 
 
 
270 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0566268 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  32.73 
 
 
270 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 
264 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3990  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.63 
 
 
267 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592711  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0858  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.97 
 
 
264 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.229661  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  34.83 
 
 
265 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  30.94 
 
 
262 aa  124  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
262 aa  123  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0140  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 
264 aa  123  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  32.97 
 
 
260 aa  122  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0590  short chain enoyl-CoA hydratase  35.85 
 
 
262 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 
263 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4841  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.59 
 
 
254 aa  121  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0729296  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2135  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.09 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.322719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2808  enoyl-CoA hydratase  32.44 
 
 
262 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000147189 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2071  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.8 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40980  enoyl-CoA hydratase  32.1 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0839  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.59 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2452  enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00421789  hitchhiker  0.00869543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3475  enoyl-CoA hydratase  32.23 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.729644  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  39.44 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  34.35 
 
 
285 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.16 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
269 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2284  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.65 
 
 
267 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.381343  hitchhiker  0.000000462375 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2165  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.192446  normal  0.593108 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1837  enoyl-CoA hydratase  36.71 
 
 
260 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.334105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4601  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.08 
 
 
256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  33.97 
 
 
285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1890  enoyl-CoA hydratase  32.72 
 
 
270 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.96141  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2792  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.82 
 
 
259 aa  119  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.552079 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2719  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.35 
 
 
270 aa  119  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.345596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1462  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.06 
 
 
259 aa  119  6e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4537  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.39 
 
 
261 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.049531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  31.72 
 
 
282 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2882  enoyl-CoA hydratase  32.12 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.785241  normal  0.389314 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.84 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.85 
 
 
265 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>