64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2513 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0863  hypothetical protein  55.97 
 
 		 1120 aa  1219    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0869  hypothetical protein  56.33 
 
 		 1118 aa  1220    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1172  hypothetical protein  54.94 
 
 		 1120 aa  1217    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0880  hypothetical protein  55.97 
 
 		 1120 aa  1219    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5159  hypothetical protein  54.96 
 
 		 1126 aa  1205    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.236742  normal  0.119537 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2513  hypothetical protein  100 
 
 		 1121 aa  2284    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.844396  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2064  hypothetical protein  33.3 
 
 		 1120 aa  462  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.203107  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22910  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1118 aa  295  3e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4003  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1126 aa  280  9e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.417635  normal  0.020693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0868  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1137 aa  278  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26370  hypothetical protein  27.88 
 
 		 1128 aa  275  4.0000000000000004e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1133  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1123 aa  267  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802022 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03539  putative ATP-binding protein  26.52 
 
 		 1143 aa  266  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.12714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3162  putative ATP-binding protein  26.08 
 
 		 1124 aa  244  7.999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3940  putative ATP-binding protein  25.24 
 
 		 1154 aa  241  4e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0051  conserved hypothetical cytosolic protein  26.68 
 
 		 1140 aa  241  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.609156  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2294  hypothetical protein  25.56 
 
 		 1125 aa  238  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237724 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0892  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1121 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3738  putative ATP-binding protein  23.43 
 
 		 1153 aa  234  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0063  putative ATP-binding protein  25.48 
 
 		 1136 aa  230  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1125  conserved hypothetical cytosolic protein  23.68 
 
 		 1133 aa  230  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0782  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1121 aa  228  3e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2280  hypothetical protein  23.83 
 
 		 1144 aa  227  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0843  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1125 aa  222  3e-56  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0273  hypothetical protein  25.91 
 
 		 1146 aa  222  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.930301  decreased coverage  0.00283769 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1565  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1151 aa  219  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.184188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2187  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1143 aa  218  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.671764  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1444  hypothetical protein  24.24 
 
 		 1121 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0015  conserved hypothetical cytosolic protein  25.02 
 
 		 1124 aa  215  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0516  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1121 aa  214  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.536264 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0735  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1122 aa  209  3e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17240  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1114 aa  205  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1809  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1121 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0224  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1133 aa  189  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00190066 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2031  hypothetical protein  26.36 
 
 		 1125 aa  174  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03620  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1166 aa  155  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.688607 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49810  hypothetical protein  23.76 
 
 		 979 aa  153  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03270  hypothetical protein  23.36 
 
 		 1045 aa  152  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.000014033  unclonable  1.7381799999999998e-20 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3697  hypothetical protein  22.59 
 
 		 694 aa  126  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000334148 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2220  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1120 aa  116  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0950228  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0424  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1181 aa  93.6  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.924929  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1628  conserved hypothetical cytosolic protein  26.42 
 
 		 1130 aa  92  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3696  hypothetical protein  26.56 
 
 		 406 aa  89  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000237881 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0875  hypothetical protein  22.9 
 
 		 462 aa  77.4  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0741  hypothetical protein  27.59 
 
 		 352 aa  77  0.000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0583  SMC domain-containing protein  21.88 
 
 		 1109 aa  75.5  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0775  MukB N-terminal domain/M protein repeat protein  20.15 
 
 		 1113 aa  61.6  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0308162 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4398  M protein-like MukB domain-containing protein  22.65 
 
 		 1093 aa  57.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2434  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1159 aa  56.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.78848  normal  0.0878063 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2156  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1159 aa  56.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2117  conserved hypothetical proteinn  34.43 
 
 		 1159 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0795  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1145 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.517535 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0979  MukB N- domain/M protein repeat protein  32.93 
 
 		 1107 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.653871  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0670  chromosome segregation ATPase-like protein  34.15 
 
 		 1159 aa  51.2  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2223  hypothetical protein  30 
 
 		 1138 aa  50.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.651164 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  52.38 
 
 		 1082 aa  49.3  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2729  hypothetical protein  21.89 
 
 		 1141 aa  48.9  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0490  chromosome segregation ATPases-like  25.11 
 
 		 1207 aa  48.5  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  35.34 
 
 		 1165 aa  48.5  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4429  chromosome segregation protein SMC  32.91 
 
 		 1190 aa  47.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0334  chromosome segregation protein SMC  41.3 
 
 		 1198 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.452064  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  48.89 
 
 		 1030 aa  45.8  0.005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  40.48 
 
 		 1217 aa  45.4  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3062  hypothetical protein  25.71 
 
 		 1140 aa  44.7  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>