141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2507 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2507  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
305 aa  575  1.0000000000000001e-163  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17200  predicted permease, DMT superfamily  55.44 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0071959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0130  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.97 
 
 
325 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0233351  normal  0.310608 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3168  hypothetical protein  46.35 
 
 
290 aa  202  7e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.302712  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1197  hypothetical protein  43.31 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4262  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.09 
 
 
297 aa  189  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5994  hypothetical protein  43.53 
 
 
305 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0942193  normal  0.150188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3217  hypothetical protein  41.55 
 
 
295 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00240946  normal  0.367781 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1964  hypothetical protein  43.84 
 
 
314 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.27 
 
 
282 aa  187  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317569  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  41.04 
 
 
292 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0068  hypothetical protein  43.06 
 
 
289 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3085  hypothetical protein  44.11 
 
 
295 aa  186  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0753098  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3433  hypothetical protein  42.25 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000302271  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0196  hypothetical protein  42.91 
 
 
305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4855  hypothetical protein  44.85 
 
 
285 aa  182  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0837  threonine and homoserine efflux system  39.79 
 
 
295 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0124814  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2239  EamA family protein  42.29 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0001908  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3499  hypothetical protein  42.29 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  normal  0.669558 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2830  threonine and homoserine efflux system  39.79 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8572  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.18 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.257363  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0962  threonine and homoserine efflux system  39.32 
 
 
299 aa  179  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0232509  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4738  hypothetical protein  40.14 
 
 
295 aa  178  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00780  threonine and homoserine efflux system  39.45 
 
 
295 aa  178  9e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2829  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.45 
 
 
295 aa  178  9e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0520778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00797  hypothetical protein  39.45 
 
 
295 aa  178  9e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0870  threonine and homoserine efflux system  39.45 
 
 
295 aa  178  9e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096225  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2535  threonine and homoserine efflux system  39.45 
 
 
295 aa  178  9e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000316984  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2981  DMT family permease  41.88 
 
 
296 aa  177  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190114  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2514  hypothetical protein  43.62 
 
 
283 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292339  normal  0.385218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0883  threonine and homoserine efflux system  39.45 
 
 
295 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000921417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1863  hypothetical protein  42.34 
 
 
295 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000217515  normal  0.404567 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2617  hypothetical protein  42.7 
 
 
289 aa  176  6e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4022  hypothetical protein  42.12 
 
 
297 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46700  hypothetical protein  42.41 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.022597  decreased coverage  0.000000235263 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.73 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1300  threonine and homoserine efflux system  40.65 
 
 
295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.332206  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2766  hypothetical protein  36.73 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3904  hypothetical protein  39.02 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544421  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2390  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.57 
 
 
288 aa  172  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01032  Transporter involved in threonine and homoserine efflux  40.5 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.614417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0094  hypothetical protein  39.42 
 
 
299 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.73224  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2840  hypothetical protein  43.48 
 
 
300 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316251  normal  0.316711 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0961  threonine and homoserine efflux system  40.21 
 
 
295 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0982  threonine and homoserine efflux system  40.21 
 
 
295 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1846  hypothetical protein  41.52 
 
 
298 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000284209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0898  threonine and homoserine efflux system  40.21 
 
 
295 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0870  threonine and homoserine efflux system  40.21 
 
 
295 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2875  threonine and homoserine efflux system  37.98 
 
 
293 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00290146  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3425  hypothetical protein  41.2 
 
 
292 aa  166  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2969  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.25 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1861  hypothetical protein  43.56 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.654734  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1976  hypothetical protein  43.7 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.487154 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4814  threonine and homoserine efflux system  41.24 
 
 
288 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.369871  normal  0.894599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2634  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.39 
 
 
280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1500  threonine and homoserine efflux system  40.85 
 
 
295 aa  161  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  3.6519e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1768  threonine and homoserine efflux system  40.85 
 
 
293 aa  161  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000270946  normal  0.0166943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5800  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.33 
 
 
322 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33827  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1605  threonine and homoserine efflux system  40.56 
 
 
295 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140132  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2802  hypothetical protein  42.69 
 
 
278 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.10684  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1587  threonine and homoserine efflux system  39.37 
 
 
295 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00642491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.18 
 
 
293 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.232417  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0928  threonine and homoserine efflux system  39.5 
 
 
286 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3044  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.78 
 
 
285 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1483  threonine and homoserine efflux system  38.28 
 
 
295 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1994  putative integral membrane protein  42.91 
 
 
300 aa  152  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13040  predicted permease, DMT superfamily  45.49 
 
 
293 aa  150  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0141388  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3407  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.52 
 
 
291 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.615579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0657  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.21 
 
 
296 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.140876 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4527  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.03 
 
 
303 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0952883 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0646  hypothetical protein  42.09 
 
 
296 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.140309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3181  hypothetical protein  38.8 
 
 
281 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.547943  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2637  hypothetical protein  37.55 
 
 
320 aa  144  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000608588  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4267  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.66 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0357814  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0625  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.31 
 
 
296 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378272  normal  0.900274 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2658  hypothetical protein  40.87 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2703  hypothetical protein  40.87 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.75974  normal  0.0221892 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2688  hypothetical protein  40.87 
 
 
297 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1557  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.03 
 
 
319 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3928  hypothetical protein  42.34 
 
 
301 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.501221  normal  0.176255 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3333  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.25 
 
 
293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222315  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3392  hypothetical protein  39.77 
 
 
277 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.529802  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2958  hypothetical protein  41.39 
 
 
303 aa  129  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395284  normal  0.675669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1578  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.18 
 
 
301 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2218  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.85 
 
 
305 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000223898  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3133  hypothetical protein  42.8 
 
 
288 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.786366  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2602  hypothetical protein  39.62 
 
 
277 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.94 
 
 
288 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34860  predicted permease, DMT superfamily  37.11 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2563  hypothetical protein  39.62 
 
 
277 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2608  hypothetical protein  39.62 
 
 
277 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02390  predicted permease, DMT superfamily  38.32 
 
 
294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.857756  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5689  hypothetical protein  37.23 
 
 
308 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0190255  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7811  hypothetical protein  34.31 
 
 
306 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01360  predicted permease, DMT superfamily  36.54 
 
 
301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.554543  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24340  predicted permease, DMT superfamily  40.08 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.557722  normal  0.167703 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1425  putative integral membrane protein  38.99 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2072  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.92 
 
 
327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.225798 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2238  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.85 
 
 
310 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2172  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.79 
 
 
314 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>