More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2499 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  100 
 
 		 156 aa  314  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  74.82 
 
 		 147 aa  212  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  74.45 
 
 		 139 aa  209  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  69.44 
 
 		 143 aa  207  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  75.18 
 
 		 150 aa  207  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 146 aa  206  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  68.06 
 
 		 148 aa  202  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  76.06 
 
 		 144 aa  202  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  71.76 
 
 		 149 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  75.35 
 
 		 147 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  70.07 
 
 		 160 aa  198  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  70.21 
 
 		 147 aa  196  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  70.63 
 
 		 147 aa  191  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  70 
 
 		 151 aa  187  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  72.03 
 
 		 148 aa  187  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  68.84 
 
 		 156 aa  186  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  70.83 
 
 		 147 aa  184  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  70.4 
 
 		 153 aa  183  9e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 148 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  63.04 
 
 		 141 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  66.39 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  61.31 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  60.29 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  56.62 
 
 		 144 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  74 
 
 		 144 aa  142  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  62.71 
 
 		 134 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  57.6 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  50.83 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  45.33 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  45.16 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.63 
 
 		 164 aa  107  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  44.26 
 
 		 144 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  42.54 
 
 		 144 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  51.69 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  49.59 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  46.02 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  41.91 
 
 		 168 aa  103  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  43.8 
 
 		 168 aa  102  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  47.5 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  44.24 
 
 		 176 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  42.98 
 
 		 168 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  39.55 
 
 		 164 aa  95.5  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  44.96 
 
 		 162 aa  90.5  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 182 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  40.8 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 204 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  35.14 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 281 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 322 aa  80.9  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 291 aa  77.4  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 292 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  41.3 
 
 		 331 aa  77.4  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 327 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 306 aa  77  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  38.95 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  38.26 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  41.49 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  41.49 
 
 		 301 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 513 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  40.66 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 261 aa  75.1  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0296  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00196972  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  36.13 
 
 		 250 aa  75.1  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5692  transcriptional regulator, AraC family  35.4 
 
 		 318 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 286 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 316 aa  73.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  43.01 
 
 		 250 aa  73.9  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  40.21 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  31.36 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  28.81 
 
 		 319 aa  72  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 290 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  41.44 
 
 		 296 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 291 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 291 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 		 255 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  35.29 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>