58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2487 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2487  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  233  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.923616  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2201  hypothetical protein  84.44 
 
 		 111 aa  165  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3417  hypothetical protein  76.58 
 
 		 111 aa  161  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0768629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3119  hypothetical protein  76.58 
 
 		 111 aa  161  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.002605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2504  hypothetical protein  77.48 
 
 		 112 aa  159  9e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205194  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2541  hypothetical protein  77.48 
 
 		 112 aa  159  9e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.618316  normal  0.614816 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2549  hypothetical protein  77.48 
 
 		 112 aa  159  9e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.640435  normal  0.556345 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12087  hypothetical protein  77.48 
 
 		 111 aa  159  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00768489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3403  hypothetical protein  70.33 
 
 		 114 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.48852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4175  hypothetical protein  58.88 
 
 		 214 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000332062  normal  0.835384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2931  hypothetical protein  64.29 
 
 		 113 aa  130  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000173599  hitchhiker  0.000432895 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2391  hypothetical protein  59.09 
 
 		 113 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000232715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2270  hypothetical protein  58.88 
 
 		 116 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681612  hitchhiker  0.00201958 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3943  hypothetical protein  57.27 
 
 		 112 aa  128  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2272  hypothetical protein  59.09 
 
 		 113 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426448  normal  0.029455 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5508  hypothetical protein  57.89 
 
 		 114 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133896  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21770  hypothetical protein  63.74 
 
 		 114 aa  128  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17145  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2706  hypothetical protein  57.27 
 
 		 114 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0447076  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1759  hypothetical protein  56.64 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2352  hypothetical protein  54.05 
 
 		 114 aa  120  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000873131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1805  hypothetical protein  55.86 
 
 		 114 aa  120  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5317  hypothetical protein  53.27 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18450  hypothetical protein  53.77 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.362245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2669  hypothetical protein  51.4 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15950  hypothetical protein  50.94 
 
 		 116 aa  106  9.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.99023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2756  hypothetical protein  56.25 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.323138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1931  hypothetical protein  50.46 
 
 		 115 aa  105  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321142 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2188  hypothetical protein  50.46 
 
 		 115 aa  104  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.147461  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2066  hypothetical protein  50.47 
 
 		 114 aa  103  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0302249 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1875  hypothetical protein  49.47 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0901789 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14110  hypothetical protein  50.46 
 
 		 117 aa  97.1  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.131861  normal  0.543027 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1212  hypothetical protein  50.91 
 
 		 114 aa  94.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.277125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1296  hypothetical protein  47.83 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1774  hypothetical protein  50 
 
 		 114 aa  90.5  7e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.932379  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0468  hypothetical protein  47.62 
 
 		 115 aa  88.2  4e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0794  hypothetical protein  48.15 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.907661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1892  hypothetical protein  47.78 
 
 		 115 aa  84  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.529355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12010  hypothetical protein  48.81 
 
 		 115 aa  83.6  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.206716  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2534  electron transport protein  36.45 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2051  electron transport protein  34.91 
 
 		 113 aa  60.5  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2804  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000011145  hitchhiker  0.0000321005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2927  electron transport protein  35.51 
 
 		 116 aa  57  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3006  putative electron transport protein  33.94 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0898243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1552  hypothetical protein  36 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2013  putative electron transport protein  29.73 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0471573  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2202  hypothetical protein  31.19 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000713588  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1939  electron transport protein  36.11 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1989  hypothetical protein  32.69 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.104533  normal  0.354487 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5195  hypothetical protein  36.78 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.993873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15910  hypothetical protein  33.33 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409629  normal  0.744065 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13150  hypothetical protein  30 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.952087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2068  electron transport protein  30.1 
 
 		 113 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.448912  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1642  hypothetical protein  29.13 
 
 		 111 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.012922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19990  hypothetical protein  36.26 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6034  hypothetical protein  29.36 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2984  hypothetical protein  27.66 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0164944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1901  electron transport protein  34.91 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0343414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7467  electron transport protein  32.14 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>