87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2444 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2444  protein of unknown function DUF75  100 
 
 		 288 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3212  hypothetical protein  71.28 
 
 		 296 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.550185  normal  0.421103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3162  hypothetical protein  71.28 
 
 		 296 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3150  hypothetical protein  71.28 
 
 		 296 aa  424  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0142521  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2143  protein of unknown function DUF75  70.11 
 
 		 301 aa  421  1e-117  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0211773  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3475  hypothetical protein  70.07 
 
 		 296 aa  419  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3052  hypothetical protein  70.61 
 
 		 292 aa  419  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22220  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  64.89 
 
 		 290 aa  394  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.737687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2210  protein of unknown function DUF75  66.05 
 
 		 298 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12157  hypothetical protein  64.31 
 
 		 292 aa  373  1e-102  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00120164  normal  0.853503 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2670  protein of unknown function DUF75  63.08 
 
 		 286 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2785  protein of unknown function DUF75  59.29 
 
 		 286 aa  349  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000787132  hitchhiker  0.0000705422 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1173  hypothetical protein  58.63 
 
 		 283 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2324  hypothetical protein  56.84 
 
 		 289 aa  330  1e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.102651  decreased coverage  0.000172466 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2170  hypothetical protein  56.49 
 
 		 289 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5919  hypothetical protein  57.5 
 
 		 284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239178  normal  0.0316841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4890  hypothetical protein  57.09 
 
 		 280 aa  315  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.0846818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  53.93 
 
 		 282 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1855  hypothetical protein  54.45 
 
 		 284 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.982924 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2290  protein of unknown function DUF75  56.29 
 
 		 286 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00121228  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2640  hypothetical protein  56.73 
 
 		 280 aa  305  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.512604  normal  0.285331 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  53.76 
 
 		 281 aa  296  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1548  protein of unknown function DUF75  53.07 
 
 		 279 aa  292  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.831749  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1842  protein of unknown function DUF75  53.68 
 
 		 294 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2009  protein of unknown function DUF75  51.23 
 
 		 285 aa  285  8e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.547664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4500  hypothetical protein  49.47 
 
 		 282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701907 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1480  protein of unknown function DUF75  50.71 
 
 		 283 aa  274  1.0000000000000001e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2246  protein of unknown function DUF75  50.9 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.640776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2169  hypothetical protein  48.54 
 
 		 301 aa  271  7e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0362139  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1912  protein of unknown function DUF75  47.81 
 
 		 301 aa  269  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000183665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20950  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  50 
 
 		 306 aa  268  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.344012  normal  0.641113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5396  protein of unknown function DUF75  50.18 
 
 		 302 aa  265  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.380305  normal  0.382515 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13900  ATP-grasp superfamily enzyme  50 
 
 		 286 aa  251  1e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.331595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1196  protein of unknown function DUF75  46.49 
 
 		 296 aa  248  9e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00179103  normal  0.0638399 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  43.27 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1077  hypothetical protein  43.11 
 
 		 299 aa  231  1e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.370003  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16230  Protein of unknown function DUF75  42.44 
 
 		 269 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  37.41 
 
 		 311 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11820  ATP-grasp superfamily enzyme  37.68 
 
 		 316 aa  192  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0485047  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0447  hypothetical protein  30.04 
 
 		 277 aa  151  8.999999999999999e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000016468  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2173  hypothetical protein  31.32 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2162  hypothetical protein  31.32 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530975  hitchhiker  0.00210211 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2219  hypothetical protein  31.32 
 
 		 334 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.849197  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1837  protein of unknown function DUF75  34.18 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1825  protein of unknown function DUF75  31.67 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  29.54 
 
 		 329 aa  126  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12728  hypothetical protein  31.91 
 
 		 324 aa  122  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  29.54 
 
 		 330 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2852  hypothetical protein  28.47 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0926  hypothetical protein  29.57 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1722  hypothetical protein  31.1 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.901753  decreased coverage  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1737  hypothetical protein  31.1 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.226503  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2427  protein of unknown function DUF75  29.07 
 
 		 315 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.175054  normal  0.221308 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2232  protein of unknown function DUF75  28.32 
 
 		 342 aa  112  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.553046  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4966  protein of unknown function DUF75  29.11 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14850  ATP-grasp superfamily enzyme  28.42 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1608  protein of unknown function DUF75  27.78 
 
 		 312 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000205047 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15610  Protein of unknown function DUF75  30.22 
 
 		 353 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1509  protein of unknown function DUF75  29.89 
 
 		 311 aa  106  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0466221  normal  0.187119 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1579  protein of unknown function DUF75  28.92 
 
 		 314 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.548098 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1247  hypothetical protein  32.39 
 
 		 312 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0984474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5648  protein of unknown function DUF75  28.32 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.424673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5208  hypothetical protein  30.18 
 
 		 307 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00169383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6868  hypothetical protein  27.72 
 
 		 302 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5325  protein of unknown function DUF75  27.4 
 
 		 298 aa  102  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16730  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  28.74 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1614  hypothetical protein  26.92 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00125325  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3749  hypothetical protein  26.07 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0709366  normal  0.107675 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22940  uncharacterized protein (ATP-grasp superfamily)  27.56 
 
 		 312 aa  99.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.15902 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0028  hypothetical protein  27.64 
 
 		 310 aa  97.8  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1658  protein of unknown function DUF75  27.74 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525262  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2326  hypothetical protein  25.7 
 
 		 301 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.402322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2127  protein of unknown function DUF75  28.85 
 
 		 316 aa  89.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.276708  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1266  protein of unknown function DUF75  26.26 
 
 		 312 aa  89.4  7e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.825703  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10660  Protein of unknown function DUF75  26.44 
 
 		 325 aa  87  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1060  protein of unknown function DUF75  27.34 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.419014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3209  hypothetical protein  25.27 
 
 		 312 aa  82.4  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0798  protein of unknown function DUF75  26.48 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13300  Protein of unknown function DUF75  23.02 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00661171  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  25.73 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  24.58 
 
 		 276 aa  63.2  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  25.31 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  24.41 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  26.14 
 
 		 261 aa  55.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  25.19 
 
 		 302 aa  52.8  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  23.53 
 
 		 302 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  22.71 
 
 		 256 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>