More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2438 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2438  undecaprenol kinase  100 
 
 
280 aa  550  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2133  undecaprenol kinase  71.07 
 
 
281 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.141893  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3043  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  69.45 
 
 
276 aa  371  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3483  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  69.09 
 
 
276 aa  358  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0662586  normal  0.599871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3170  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  69.45 
 
 
276 aa  358  8e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.822675  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3220  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  69.45 
 
 
276 aa  358  8e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3158  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  69.2 
 
 
282 aa  357  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12166  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  65.22 
 
 
276 aa  351  8e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.490022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2318  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.95 
 
 
278 aa  318  5e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2164  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  62.23 
 
 
278 aa  312  4.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0646427  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3522  undecaprenol kinase  58.48 
 
 
274 aa  298  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555118  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2623  undecaprenyl-diphosphatase  55.15 
 
 
274 aa  276  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.151549  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2660  undecaprenol kinase  53.07 
 
 
277 aa  262  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1937  undecaprenol kinase  53.31 
 
 
272 aa  255  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.07864  normal  0.489948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1838  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  48.36 
 
 
292 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4503  undecaprenol kinase  50 
 
 
278 aa  252  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978161  decreased coverage  0.00384903 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09180  Undecaprenyl-diphosphatase  49.47 
 
 
281 aa  249  3e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.352379  normal  0.402204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16250  Undecaprenyl-diphosphatase  48.16 
 
 
290 aa  245  6e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0295918  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20010  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  49.28 
 
 
286 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00122239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5676  undecaprenol kinase  50.54 
 
 
278 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.229303  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1910  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.54 
 
 
277 aa  242  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0789  Undecaprenyl-diphosphatase  48.41 
 
 
279 aa  240  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0413787  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2167  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50 
 
 
286 aa  236  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00790926  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2797  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  51.84 
 
 
292 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4459  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  47.16 
 
 
278 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.806671  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20990  Undecaprenyl-diphosphatase  49.62 
 
 
285 aa  231  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.475195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2282  undecaprenol kinase  47.65 
 
 
273 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000232331  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11800  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  50.89 
 
 
277 aa  229  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2775  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  45 
 
 
280 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000224739  hitchhiker  0.000207521 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4500  undecaprenol kinase  44.93 
 
 
386 aa  228  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2249  undecaprenol kinase  48.43 
 
 
290 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.221802  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1818  putative undecaprenol kinase  51.92 
 
 
281 aa  221  7e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1478  undecaprenol kinase  46.99 
 
 
290 aa  221  9e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.310776  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0102  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.64 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2011  undecaprenol kinase  47.46 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0766  undecaprenyl-diphosphatase  50.18 
 
 
276 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.935106  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1194  undecaprenol kinase  44.95 
 
 
289 aa  219  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0743133  normal  0.0386066 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0446  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.21 
 
 
294 aa  218  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0953446  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1692  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.36 
 
 
282 aa  217  2e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0482  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.51 
 
 
282 aa  210  2e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0712412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1869  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  43.45 
 
 
282 aa  210  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1735  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.16 
 
 
283 aa  206  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3596  undecaprenol kinase  44.19 
 
 
272 aa  202  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.557046  normal  0.0100362 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2250  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.46 
 
 
282 aa  201  8e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.246331  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3860  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.5 
 
 
278 aa  198  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0340187  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0633  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.4 
 
 
320 aa  198  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.395478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2469  undecaprenyl-diphosphatase  40.13 
 
 
339 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0199195  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0444  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.59 
 
 
282 aa  187  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4191  undecaprenol kinase  41.24 
 
 
320 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195911 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0665  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  42.55 
 
 
282 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.790774  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40.36 
 
 
288 aa  186  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.39732  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02211  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  44.74 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2864  undecaprenol kinase  39.93 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3232  undecaprenol kinase  39.93 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.14463 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0831  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.76 
 
 
266 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000733877  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0054  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.79 
 
 
267 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.849769  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  41.79 
 
 
287 aa  177  2e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.684943  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1004  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.64 
 
 
266 aa  176  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00218186  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.46 
 
 
266 aa  175  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000507346  normal  0.0186967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2988  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.76 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22302  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03448  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.49 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2826  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.49 
 
 
266 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0258083  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1080  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.46 
 
 
266 aa  170  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.025115  normal  0.0318175 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1196  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.74 
 
 
266 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.38552  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1152  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.74 
 
 
266 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0107738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3161  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.74 
 
 
266 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.166065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1229  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.74 
 
 
266 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.188967  normal  0.828376 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0967  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.52 
 
 
266 aa  169  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000277611  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0725  putative undecaprenol kinase  42.15 
 
 
281 aa  170  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60596  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2690  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  35.69 
 
 
267 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0358  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  40 
 
 
283 aa  168  9e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1112  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.35 
 
 
266 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0511751  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00857  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.16 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1243  undecaprenyl-diphosphatase  41.09 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.373475  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4798  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.93 
 
 
312 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0638126  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1258  putative undecaprenol kinase  37.6 
 
 
266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0835  putative undecaprenol kinase  39.55 
 
 
261 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2900  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.37 
 
 
266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000171872  hitchhiker  0.00310474 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.7 
 
 
266 aa  165  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000265247  normal  0.0325105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0859  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.15 
 
 
265 aa  165  9e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.136204  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1293  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.93 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0571  undecaprenyl-diphosphatase  39.25 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000920571  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1046  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  39.68 
 
 
266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.403088  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001615  undecaprenyl-diphosphatase  36.02 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.754191  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3079  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  38.31 
 
 
266 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000402787  hitchhiker  0.000110781 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0330  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.74 
 
 
266 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0163  putative undecaprenol kinase  37.72 
 
 
304 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.714151  normal  0.0225352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3549  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  34.91 
 
 
269 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3583  putative undecaprenol kinase  38.77 
 
 
273 aa  158  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4342  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  37.55 
 
 
272 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2232  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.58 
 
 
265 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00497106  hitchhiker  0.0000196312 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1845  undecaprenol kinase  41.06 
 
 
262 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3133  undecaprenyl-diphosphatase  37.36 
 
 
269 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000445999  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4137  putative undecaprenol kinase  36.98 
 
 
270 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.383043  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3115  undecaprenol kinase  36.47 
 
 
264 aa  154  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0174  putative undecaprenol kinase  37.55 
 
 
267 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0572  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  36.03 
 
 
270 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06831  bacitracin resistance protein BacA  36.69 
 
 
291 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.834409 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2769  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.57 
 
 
259 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2722  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  33.94 
 
 
259 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>