More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2433 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  72.35 
 
 
450 aa  660  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  72.08 
 
 
444 aa  656  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  100 
 
 
448 aa  913  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  74.14 
 
 
451 aa  658  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  72.08 
 
 
444 aa  655  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  72.08 
 
 
444 aa  656  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  72.16 
 
 
430 aa  637  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  75.85 
 
 
446 aa  701  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  65.15 
 
 
439 aa  583  1e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  65.76 
 
 
443 aa  575  1e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  57.83 
 
 
442 aa  504  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  55.94 
 
 
442 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  56.4 
 
 
442 aa  491  1e-138  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  55.43 
 
 
449 aa  492  1e-138  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  5.30587e-05  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  56.95 
 
 
462 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  56.58 
 
 
440 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  57.51 
 
 
433 aa  481  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  58.72 
 
 
440 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  56.45 
 
 
435 aa  471  1e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  56.29 
 
 
432 aa  471  1e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  55.61 
 
 
443 aa  471  1e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  54.84 
 
 
452 aa  471  1e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  56.39 
 
 
434 aa  457  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  55.4 
 
 
446 aa  445  1e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  51.25 
 
 
434 aa  429  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  52.12 
 
 
441 aa  428  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  51.15 
 
 
434 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.7088e-12 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  51.71 
 
 
429 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  49.43 
 
 
439 aa  422  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  52.07 
 
 
444 aa  418  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  51.49 
 
 
438 aa  417  1e-115  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  53.09 
 
 
442 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  50 
 
 
445 aa  402  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  52.5 
 
 
444 aa  396  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  50 
 
 
451 aa  387  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  47.48 
 
 
421 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  48.97 
 
 
437 aa  375  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  3.18209e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  47 
 
 
441 aa  371  1e-101  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  45.5 
 
 
434 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  7.70232e-07  decreased coverage  7.00572e-05 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  44.93 
 
 
428 aa  340  3e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  44.11 
 
 
468 aa  337  3e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  41.52 
 
 
468 aa  309  5e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  31.29 
 
 
434 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  29.49 
 
 
478 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  30.4 
 
 
469 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  30.96 
 
 
473 aa  167  3e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  27.88 
 
 
485 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.36 
 
 
477 aa  156  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  30.13 
 
 
494 aa  150  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  27.83 
 
 
472 aa  143  7e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  31.89 
 
 
497 aa  142  2e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  30.16 
 
 
489 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  29.03 
 
 
549 aa  129  2e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  29.86 
 
 
487 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  28.95 
 
 
467 aa  126  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  27.82 
 
 
468 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  29.18 
 
 
493 aa  121  2e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  30.11 
 
 
493 aa  121  2e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  27.23 
 
 
476 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  27.16 
 
 
457 aa  120  4e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  27.05 
 
 
508 aa  119  8e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  31.47 
 
 
493 aa  119  1e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  28.51 
 
 
491 aa  116  1e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  28.28 
 
 
510 aa  114  4e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  28.84 
 
 
493 aa  111  2e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.65 
 
 
413 aa  112  2e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  26.62 
 
 
490 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  26.36 
 
 
494 aa  111  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  27.93 
 
 
421 aa  110  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  27.42 
 
 
507 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  27.42 
 
 
507 aa  103  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15083  predicted protein  25.97 
 
 
374 aa  103  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0450  hypothetical protein  26.18 
 
 
477 aa  102  9e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  3.07009e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.5 
 
 
388 aa  101  3e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  25.5 
 
 
440 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  25.31 
 
 
485 aa  99.8  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  24.71 
 
 
390 aa  98.6  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  24.61 
 
 
391 aa  96.3  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.45 
 
 
433 aa  94.4  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  28.14 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  27.74 
 
 
419 aa  89.4  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  24.04 
 
 
395 aa  88.6  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  26.03 
 
 
465 aa  88.2  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  27.85 
 
 
399 aa  88.2  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  26.79 
 
 
415 aa  85.9  1e-15  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.42 
 
 
395 aa  84.7  3e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.87 
 
 
393 aa  84.3  4e-15  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  26.37 
 
 
397 aa  84  5e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  30.49 
 
 
409 aa  84  5e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  25.3 
 
 
415 aa  83.2  9e-15  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  26.12 
 
 
397 aa  82.8  1e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  29.75 
 
 
396 aa  82.4  1e-14  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.7221e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  26.49 
 
 
413 aa  83.2  1e-14  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  23.04 
 
 
483 aa  82  2e-14  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  24.75 
 
 
428 aa  81.6  2e-14  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30 
 
 
396 aa  81.3  4e-14  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  25.87 
 
 
423 aa  80.9  5e-14  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  2.46987e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  25 
 
 
415 aa  79.7  9e-14  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  25.96 
 
 
397 aa  79.3  1e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  25 
 
 
374 aa  78.6  2e-13  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>