More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2404 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2404  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 396 aa  791    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2078  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  84.36 
 
 		 362 aa  541  1e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11508  transcriptional regulatory protein moxR1  78.08 
 
 		 377 aa  534  1e-150  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.269951  normal  0.0724803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22380  MoxR-like ATPase  75.6 
 
 		 345 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0356507  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3661  ATPase  76.88 
 
 		 386 aa  513  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.199881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2453  ATPase  68.17 
 
 		 390 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.664644  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2498  ATPase  68.17 
 
 		 390 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2749  ATPase  77.19 
 
 		 385 aa  513  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483523 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2490  ATPase  68.17 
 
 		 390 aa  513  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0433704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2298  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  77.67 
 
 		 360 aa  508  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0063756  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2145  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  77.18 
 
 		 346 aa  504  1e-141  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0131519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2086  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  74.76 
 
 		 432 aa  498  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3028  ATPase  65.23 
 
 		 370 aa  461  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2493  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  69.09 
 
 		 378 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3254  ATPase  68.51 
 
 		 371 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1386  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  60.74 
 
 		 369 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00566966  hitchhiker  0.00712673 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1954  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  64.65 
 
 		 353 aa  411  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.25859  hitchhiker  0.000487969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5129  ATPase  67.68 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.651869  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1135  ATPase  64.91 
 
 		 369 aa  410  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.100674  hitchhiker  0.0000389155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1795  ATPase  64.63 
 
 		 346 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1245  ATPase  66.77 
 
 		 348 aa  402  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.52678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5501  ATPase  61.76 
 
 		 334 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0337112  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1676  MoxR-like ATPase  62.3 
 
 		 339 aa  390  1e-107  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2379  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  63.21 
 
 		 336 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000313981  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4478  ATPase  58.65 
 
 		 337 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2315  ATPase  54.99 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3245  ATPase  54.84 
 
 		 339 aa  377  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3891  ATPase  57.05 
 
 		 344 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.172057 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4903  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.94 
 
 		 344 aa  369  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.512552  normal  0.346219 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1314  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.72 
 
 		 350 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.239316 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1243  Sigma 54 interacting domain protein  55.24 
 
 		 337 aa  359  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3035  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.49 
 
 		 354 aa  355  5e-97  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0745006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1063  ATPase  54.66 
 
 		 345 aa  352  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.492024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1478  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.7 
 
 		 342 aa  329  6e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  0.470444 
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  51.67 
 
 		 331 aa  327  3e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  47.99 
 
 		 328 aa  323  4e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  50.16 
 
 		 325 aa  322  6e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  50 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.56 
 
 		 329 aa  317  2e-85  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  48.37 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1126  ATPase  49.84 
 
 		 327 aa  317  2e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02165  putative magnesium chelatase  48.2 
 
 		 333 aa  317  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0433  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.03 
 
 		 333 aa  316  5e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  47.28 
 
 		 330 aa  314  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1684  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.2 
 
 		 333 aa  314  1.9999999999999998e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.059428  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.26 
 
 		 331 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0715  ATPase  48.52 
 
 		 334 aa  311  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2939  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.85 
 
 		 325 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.346358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  49.67 
 
 		 328 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  49.52 
 
 		 332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1643  ATPase  46.33 
 
 		 340 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.5 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.28 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0319  hypothetical protein  50.79 
 
 		 335 aa  300  2e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00084292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4318  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.21 
 
 		 317 aa  300  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.42 
 
 		 332 aa  300  4e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1747  MoxR-like ATPase  50.17 
 
 		 321 aa  300  4e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.54 
 
 		 329 aa  300  4e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.816775  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2442  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.5 
 
 		 329 aa  298  9e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3028  ATPase  49.84 
 
 		 318 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2678  ATPase  50.65 
 
 		 318 aa  298  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1528  ATPase  50 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1627  ATPase  49.19 
 
 		 318 aa  298  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00296265 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.06 
 
 		 332 aa  297  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1662  ATPase  49.83 
 
 		 318 aa  296  6e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2812  MoxR-like ATPase  47.44 
 
 		 319 aa  295  9e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0519  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.04 
 
 		 350 aa  295  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.67 
 
 		 327 aa  295  1e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2427  ATPase  49.03 
 
 		 318 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2344  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.45 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2741  hypothetical protein  47 
 
 		 347 aa  293  4e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  48.21 
 
 		 320 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2600  ATPase  50 
 
 		 318 aa  292  7e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.373981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1406  ATPase  48.7 
 
 		 318 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000750506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1471  ATPase  48.7 
 
 		 318 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.928753  hitchhiker  0.00766173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1459  ATPase  48.7 
 
 		 318 aa  291  2e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.938434  hitchhiker  0.000000501393 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0252  hypothetical protein  46.89 
 
 		 316 aa  290  2e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.486199  normal  0.225181 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2461  ATPase  48.38 
 
 		 335 aa  290  4e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.426275  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4526  MoxR-like ATPase  48.54 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0226415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3090  MoxR domain-containing protein  48.38 
 
 		 316 aa  288  9e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2857  ATPase  48.38 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.43371  hitchhiker  0.00084554 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2782  ATPase  48.38 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1596  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.38 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.499216  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2762  ATPase  48.38 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.433107  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2771  hypothetical protein  48.37 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2988  hypothetical protein  45.93 
 
 		 332 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2917  hypothetical protein  48.37 
 
 		 331 aa  285  7e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5141  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.76 
 
 		 325 aa  285  8e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05147  MoxR-like ATPase  50.17 
 
 		 318 aa  285  9e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0111  magnesium chelatase, subunit I, putative  47.13 
 
 		 332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02702  putative ATPase family protein  48.68 
 
 		 318 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.503742  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5165  ATPase  46.86 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5254  ATPase  46.86 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5546  ATPase  46.86 
 
 		 333 aa  284  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  45 
 
 		 340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3759  moxR protein, putative  47.37 
 
 		 319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1592  ATPase  48.03 
 
 		 319 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.985191  hitchhiker  0.0000131092 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2374  ATPase  45.35 
 
 		 363 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1721  moxR protein, putative  47.37 
 
 		 319 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2135  MoxR-like ATPase, putative transcriptional regulator, C1 metabolism  47.4 
 
 		 319 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.783557  decreased coverage  0.00358329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>