More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2354 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  73.5 
 
 		 207 aa  291  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  71.07 
 
 		 201 aa  272  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  70.56 
 
 		 203 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  70.56 
 
 		 203 aa  271  7e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  70.05 
 
 		 203 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  70.05 
 
 		 205 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  70.56 
 
 		 203 aa  265  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  66.84 
 
 		 202 aa  248  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  65.33 
 
 		 209 aa  247  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  63.08 
 
 		 208 aa  242  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  66.67 
 
 		 199 aa  235  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  65.82 
 
 		 212 aa  234  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  62 
 
 		 220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  62 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  60.1 
 
 		 208 aa  231  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  60 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  60.29 
 
 		 202 aa  227  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  59.7 
 
 		 217 aa  224  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  61.93 
 
 		 221 aa  223  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  59.11 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  61.5 
 
 		 205 aa  217  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  54.59 
 
 		 193 aa  206  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  54.04 
 
 		 226 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  58.5 
 
 		 200 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  59.2 
 
 		 204 aa  203  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  54.26 
 
 		 227 aa  198  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  52.53 
 
 		 222 aa  196  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  53.27 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  54.37 
 
 		 233 aa  194  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  49.34 
 
 		 238 aa  194  9e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 214 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  53.54 
 
 		 223 aa  191  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  50.96 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  54.37 
 
 		 214 aa  190  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  49.49 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  51.02 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  50.78 
 
 		 214 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  53.06 
 
 		 196 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  51.76 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  51.96 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 		 214 aa  181  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  47.72 
 
 		 217 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  47.98 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  47.57 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  46.86 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  48.48 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10860  riboflavin synthase, alpha subunit  47.83 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0695867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  48.47 
 
 		 216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  49.75 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  53.33 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  48.79 
 
 		 219 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  49.5 
 
 		 227 aa  171  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  48.1 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  43.46 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  44.9 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  46.15 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  49.49 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  49.49 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  49.49 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  48.79 
 
 		 220 aa  168  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  46.86 
 
 		 221 aa  167  9e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  46.38 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  46.38 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  46.38 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  46.04 
 
 		 217 aa  166  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 208 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  47.6 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  44.55 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  47.96 
 
 		 199 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  46.86 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  43.15 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 192 aa  165  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  46.63 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  46.38 
 
 		 219 aa  165  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  45.41 
 
 		 201 aa  165  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  46.86 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  48.79 
 
 		 220 aa  164  6.9999999999999995e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  46.94 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  46.38 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 216 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  48.24 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  41.33 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>