More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2351 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2351  Fmu (Sun) domain protein  100 
 
 
460 aa  900  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00754166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2566  Fmu (Sun) domain protein  67.56 
 
 
452 aa  597  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.178272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2688  Fmu (Sun) domain-containing protein  65.18 
 
 
449 aa  521  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3729  Fmu (Sun) domain-containing protein  64.89 
 
 
462 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0369477  normal  0.0235676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2425  Fmu (Sun) domain-containing protein  63.78 
 
 
455 aa  504  1e-142  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2431  Fmu (Sun) domain-containing protein  63.56 
 
 
455 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447758  normal  0.478955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2384  Fmu (Sun)  63.56 
 
 
455 aa  503  1e-141  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11436  fmu protein (sun protein)  63.23 
 
 
457 aa  493  1e-138  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0300699  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5223  Fmu (Sun) domain protein  65.09 
 
 
478 aa  491  1e-138  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.103828  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15690  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  60.49 
 
 
484 aa  489  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.822345  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4155  Fmu (Sun) domain protein  58.7 
 
 
494 aa  452  1e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0367885  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1870  Fmu (Sun) domain-containing protein  58.81 
 
 
509 aa  441  1e-122  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1369  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.31 
 
 
465 aa  405  1e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.217845  normal  0.0543141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2999  Fmu (Sun) domain protein  54.86 
 
 
471 aa  398  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119438  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1863  Fmu (Sun) domain-containing protein  56.39 
 
 
508 aa  397  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2826  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  53.12 
 
 
515 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0558477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18100  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  54.43 
 
 
505 aa  389  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.688952 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1720  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.36 
 
 
495 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.847292  hitchhiker  0.00284187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2443  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.39 
 
 
472 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0855  Fmu (Sun) domain protein  52.41 
 
 
489 aa  365  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.212848  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1076  putative RNA-binding Sun protein  52.06 
 
 
476 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1312  Fmu (Sun) domain protein  50.64 
 
 
517 aa  358  1e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.174592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16120  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  48.85 
 
 
551 aa  358  1e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3100  Fmu (Sun) domain protein  50.41 
 
 
493 aa  356  4e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.831466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1856  Fmu (Sun) domain protein  53.73 
 
 
509 aa  357  4e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.192646  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3189  putative RNA-binding Sun protein  50.42 
 
 
491 aa  345  7e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000532749  normal  0.349925 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1666  Fmu (Sun) domain protein  47.85 
 
 
527 aa  337  2e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39928e-14 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1723  Fmu (Sun) domain protein  50.52 
 
 
517 aa  337  3e-91  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00114833  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1277  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.69 
 
 
440 aa  335  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00916342  normal  0.333018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2049  Fmu (Sun) domain protein  51.76 
 
 
480 aa  333  3e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0537462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1672  Fmu (Sun) domain-containing protein  46.03 
 
 
539 aa  332  9e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.280936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3118  Fmu (Sun) domain protein  53.11 
 
 
460 aa  329  7e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2983  Fmu (Sun) domain protein  50.21 
 
 
486 aa  326  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10810  ribosomal RNA small subunit methyltransferase RsmB  47.73 
 
 
543 aa  318  1e-85  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0262439  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12780  tRNA/rRNA cytosine-C5-methylase  46.52 
 
 
502 aa  317  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0499293  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2576  Fmu (Sun) domain-containing protein  60.44 
 
 
532 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.263065  normal  0.0210244 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  33.04 
 
 
453 aa  231  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  33.77 
 
 
452 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  34.93 
 
 
452 aa  226  6e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  38.01 
 
 
446 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  30.3 
 
 
455 aa  221  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  34.86 
 
 
452 aa  220  4e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  29.87 
 
 
462 aa  214  2e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  29.28 
 
 
449 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  35.7 
 
 
457 aa  206  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  34.56 
 
 
451 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  34.19 
 
 
448 aa  201  2e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  5.93735e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  34 
 
 
443 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  34.06 
 
 
452 aa  197  2e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  30.87 
 
 
456 aa  198  2e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  35.02 
 
 
448 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  27.37 
 
 
444 aa  196  5e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  35.87 
 
 
448 aa  196  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  28.63 
 
 
435 aa  196  8e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  31.95 
 
 
449 aa  194  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  34.8 
 
 
448 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  32.26 
 
 
453 aa  193  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  31.44 
 
 
447 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  34.2 
 
 
432 aa  192  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  34.5 
 
 
449 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  31.82 
 
 
444 aa  190  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  5.12112e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  33.41 
 
 
444 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  31.69 
 
 
446 aa  187  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  32.02 
 
 
444 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  31.8 
 
 
444 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  31.8 
 
 
444 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  31.8 
 
 
444 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  31.8 
 
 
444 aa  186  6e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  32.02 
 
 
444 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  31.95 
 
 
444 aa  185  1e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  36.91 
 
 
451 aa  184  3e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  31.8 
 
 
444 aa  183  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  29.89 
 
 
443 aa  182  8e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  34.22 
 
 
451 aa  182  9e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  31.36 
 
 
444 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  33.91 
 
 
453 aa  181  3e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2583  sun protein  34.96 
 
 
501 aa  180  5e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0446199  normal  0.0296322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  28.88 
 
 
442 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1394  RNA-binding protein  29.31 
 
 
442 aa  179  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4081  NusB/RsmB/TIM44  39.38 
 
 
455 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.468028  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  30.35 
 
 
444 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  30.14 
 
 
462 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  28.88 
 
 
442 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4114  NusB/RsmB/TIM44  39.82 
 
 
455 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.155532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  34.33 
 
 
464 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  31.91 
 
 
440 aa  176  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3970  NusB/RsmB/TIM44 family protein  39.33 
 
 
455 aa  175  1e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110123  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  30.58 
 
 
425 aa  173  7e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0448  NusB/RsmB/TIM44  38.17 
 
 
439 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.455606  normal  0.168542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  30.35 
 
 
429 aa  170  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.45 
 
 
424 aa  169  8e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  30.09 
 
 
452 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  31.32 
 
 
429 aa  167  4e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  4.68931e-05 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  26 
 
 
435 aa  166  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  26 
 
 
435 aa  166  8e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  30.6 
 
 
426 aa  166  1e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  31.38 
 
 
432 aa  164  3e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  28.98 
 
 
451 aa  163  5e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  28.89 
 
 
427 aa  163  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  29.88 
 
 
429 aa  163  8e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>