More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2329 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
452 aa  906    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  71.97 
 
 
439 aa  619  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  70.55 
 
 
439 aa  610  1e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  54.05 
 
 
493 aa  452  1.0000000000000001e-126  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  54.29 
 
 
453 aa  450  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  56.63 
 
 
444 aa  449  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  46.47 
 
 
458 aa  398  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  46.68 
 
 
468 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  43.7 
 
 
442 aa  355  8.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  42.26 
 
 
477 aa  350  2e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  41.81 
 
 
464 aa  348  9e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 
469 aa  348  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 
461 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  42.6 
 
 
461 aa  345  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  40.93 
 
 
461 aa  345  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  40.99 
 
 
457 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 
468 aa  342  7e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  40.36 
 
 
457 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  41.16 
 
 
459 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  41.37 
 
 
477 aa  339  5e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  41.54 
 
 
467 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  40.13 
 
 
457 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  40.36 
 
 
457 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 
468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  39.6 
 
 
461 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  42.19 
 
 
463 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  41.5 
 
 
477 aa  325  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  40.09 
 
 
456 aa  298  1e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  39.34 
 
 
406 aa  293  4e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  37.68 
 
 
450 aa  293  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  36.83 
 
 
450 aa  276  5e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  39.39 
 
 
441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  40.24 
 
 
461 aa  273  3e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 
446 aa  271  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  36.58 
 
 
447 aa  268  1e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  37.38 
 
 
461 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  37.38 
 
 
461 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  37.38 
 
 
461 aa  268  2e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  37.28 
 
 
460 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  37.06 
 
 
460 aa  265  2e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  37.44 
 
 
445 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  37.53 
 
 
456 aa  264  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  38.69 
 
 
440 aa  263  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  37.86 
 
 
445 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  38.1 
 
 
445 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  38.1 
 
 
445 aa  262  8e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.81 
 
 
437 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  36.58 
 
 
433 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  36.58 
 
 
433 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  36.58 
 
 
433 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  37.07 
 
 
447 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  36.34 
 
 
433 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  38.25 
 
 
442 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  38.5 
 
 
438 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  38.16 
 
 
472 aa  256  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3832  major facilitator transporter  37.66 
 
 
432 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.143168  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3818  major facilitator transporter  37.66 
 
 
432 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3906  major facilitator superfamily transporter  37.66 
 
 
432 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.162053  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0577  General substrate transporter  35.09 
 
 
460 aa  256  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.129173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  36.34 
 
 
433 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  36.87 
 
 
445 aa  256  8e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  38.5 
 
 
439 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  37.59 
 
 
430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  36.76 
 
 
459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  37.79 
 
 
438 aa  253  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.93 
 
 
438 aa  253  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  35.63 
 
 
430 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  38.05 
 
 
458 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  36.99 
 
 
482 aa  250  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1662  shikimate transporter  36.53 
 
 
438 aa  250  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.520984  normal  0.0496454 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2823  shikimate transporter  36.53 
 
 
438 aa  250  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.347269  normal  0.535086 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1144  shikimate transporter  36.53 
 
 
438 aa  250  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000733491  hitchhiker  0.000000475287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  38.39 
 
 
433 aa  249  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2571  shikimate transporter  36.3 
 
 
437 aa  249  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.168346 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01893  shikimate transporter  36.3 
 
 
438 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1672  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  36.3 
 
 
438 aa  249  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01882  hypothetical protein  36.3 
 
 
438 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2263  shikimate transporter  35.78 
 
 
438 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  36.09 
 
 
457 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  36.09 
 
 
457 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  34.8 
 
 
450 aa  249  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  36.09 
 
 
457 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2104  shikimate transporter  36.3 
 
 
438 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000181469  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0212  shikimate transporter  33.94 
 
 
465 aa  247  3e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  35.33 
 
 
443 aa  246  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0365  general substrate transporter  33.49 
 
 
459 aa  246  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  35.51 
 
 
439 aa  246  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.59 
 
 
437 aa  246  8e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  37.31 
 
 
430 aa  246  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  37.38 
 
 
461 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  36.98 
 
 
439 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.76 
 
 
452 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  39.91 
 
 
439 aa  245  9.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0207  shikimate transporter  33.86 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  37.95 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  37.85 
 
 
459 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  35.1 
 
 
435 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  35.1 
 
 
435 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  35.33 
 
 
439 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  35.1 
 
 
435 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>