More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2294 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  100 
 
 
274 aa  548  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1928  protein serine/threonine phosphatase  57.79 
 
 
270 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0340359  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  47.21 
 
 
285 aa  194  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  49.35 
 
 
266 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  44.14 
 
 
323 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  44.92 
 
 
325 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  45.58 
 
 
296 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  47.25 
 
 
256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1755  protein serine/threonine phosphatase  43.62 
 
 
284 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.959742  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  43.95 
 
 
293 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  43.16 
 
 
258 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0386  protein serine/threonine phosphatase  44.49 
 
 
250 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169531  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.24 
 
 
280 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  41.95 
 
 
395 aa  155  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  37.97 
 
 
554 aa  154  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  42.74 
 
 
452 aa  151  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0456  protein serine/threonine phosphatase  38.93 
 
 
287 aa  151  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137154  normal  0.894347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  41.67 
 
 
270 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  44.81 
 
 
252 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  40.25 
 
 
425 aa  148  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  41.3 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  38.75 
 
 
394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  37.18 
 
 
564 aa  145  5e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3832  protein serine/threonine phosphatase  40.54 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.982959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  37.6 
 
 
238 aa  145  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2423  protein phosphatase 2C-like  41.85 
 
 
259 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  40.34 
 
 
267 aa  142  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  38.17 
 
 
247 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  38.56 
 
 
571 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3941  protein serine/threonine phosphatases  40.08 
 
 
261 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  36.59 
 
 
271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  39.83 
 
 
422 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.18 
 
 
271 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.92 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  39.3 
 
 
256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  37.34 
 
 
241 aa  133  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0031  protein serine/threonine phosphatase  36.61 
 
 
477 aa  133  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  36.18 
 
 
500 aa  133  3.9999999999999996e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  38.56 
 
 
469 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.65 
 
 
438 aa  132  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  38.49 
 
 
479 aa  132  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  38.66 
 
 
262 aa  132  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  39.15 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  39.48 
 
 
416 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4681  protein serine/threonine phosphatase  38.25 
 
 
270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  38.96 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  39.41 
 
 
236 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  37.07 
 
 
467 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3749  protein serine/threonine phosphatase  38.91 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3832  protein serine/threonine phosphatase  38.91 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.140812  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  37.13 
 
 
540 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  36.43 
 
 
319 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  36.21 
 
 
264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  34.75 
 
 
567 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3817  protein phosphatase 2C-like protein  36.76 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10380  serine/threonine protein phosphatase  39.29 
 
 
255 aa  129  6e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0515655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  36.82 
 
 
256 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  34.69 
 
 
243 aa  129  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  34.43 
 
 
558 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4033  protein serine/threonine phosphatase  38.79 
 
 
404 aa  128  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0763  Serine/threonine protein phosphatase  35.6 
 
 
250 aa  128  9.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000015661 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2086  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.74 
 
 
239 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.440717  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05590  serine/threonine protein phosphatase  37.61 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721089  normal  0.280672 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0952  protein phosphatase 2C-like protein  37.65 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3950  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.06 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0256176 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3183  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.84 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.07989  normal  0.11146 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  35.63 
 
 
246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  37.4 
 
 
320 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  34.27 
 
 
245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.85 
 
 
238 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  38.27 
 
 
421 aa  125  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42890  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  36.71 
 
 
242 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.566256 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  30.45 
 
 
241 aa  125  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  35.18 
 
 
474 aa  124  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02467  protein phosphatase  40 
 
 
234 aa  124  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3602  serine/threonine phosphoprotein phosphatase Stp1  36.71 
 
 
242 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.98 
 
 
237 aa  125  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  33.74 
 
 
236 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  36.4 
 
 
507 aa  124  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1685  protein serine/threonine phosphatase  40.43 
 
 
221 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.614015  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  40 
 
 
239 aa  124  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1588  protein serine/threonine phosphatase  36.48 
 
 
267 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1071  protein serine/threonine phosphatase  35.56 
 
 
538 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821303  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2314  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.71 
 
 
243 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109306  hitchhiker  0.0000219679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  36.29 
 
 
597 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5906  protein serine/threonine phosphatase  36.15 
 
 
257 aa  123  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.615058  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2371  protein serine/threonine phosphatase  35.66 
 
 
255 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2458  protein phosphatase 2C domain-containing protein  38.34 
 
 
258 aa  123  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.469461 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0099  protein serine/threonine phosphatase  37.45 
 
 
449 aa  123  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  34.85 
 
 
240 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  35.32 
 
 
472 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  36.93 
 
 
463 aa  123  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  40.17 
 
 
321 aa  123  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  33.2 
 
 
548 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  38.78 
 
 
234 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  38.7 
 
 
519 aa  122  8e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  35.41 
 
 
505 aa  121  9e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0927  protein serine/threonine phosphatase  30.86 
 
 
273 aa  122  9e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00103547  hitchhiker  1.35771e-17 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4004  protein serine/threonine phosphatase  36.44 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.467216  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  35.02 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>