60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2285 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  100 
 
 		 463 aa  897    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  40.6 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  39.6 
 
 		 426 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  41.44 
 
 		 411 aa  186  7e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  35.74 
 
 		 478 aa  153  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  37.85 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  37.85 
 
 		 417 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  32.34 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  32.34 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  32.34 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  36.25 
 
 		 419 aa  143  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  33.93 
 
 		 477 aa  138  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  35.44 
 
 		 444 aa  137  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  33.14 
 
 		 408 aa  136  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  37.83 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  33.23 
 
 		 420 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  35.67 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  33.66 
 
 		 420 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  31.86 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  34.56 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  35.22 
 
 		 417 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  34.11 
 
 		 402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  36.23 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  32.22 
 
 		 428 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  32.91 
 
 		 430 aa  123  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  35.8 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  35.5 
 
 		 398 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  35.83 
 
 		 421 aa  121  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  32.35 
 
 		 467 aa  119  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  31.89 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  36.62 
 
 		 470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  33.25 
 
 		 570 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  32.32 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  31.95 
 
 		 412 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  33.23 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  33.23 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  33.23 
 
 		 443 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  33.23 
 
 		 443 aa  110  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  35.56 
 
 		 417 aa  110  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  32.11 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  29.66 
 
 		 494 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  30.23 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  33.23 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  33.23 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  33.23 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  29.71 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  29.71 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  29.71 
 
 		 438 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  31.35 
 
 		 422 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  31.35 
 
 		 422 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  31.35 
 
 		 422 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  33.01 
 
 		 406 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  31.83 
 
 		 410 aa  96.7  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  28.61 
 
 		 437 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  35.37 
 
 		 378 aa  86.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  30.08 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  29.18 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  28.85 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  30.06 
 
 		 375 aa  48.5  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1662  hypothetical protein  30.29 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>