63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2282 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  100 
 
 		 469 aa  921    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  40.6 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  36.87 
 
 		 426 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  39.14 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  32.69 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  32.69 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  34.62 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  34.92 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  31.27 
 
 		 425 aa  152  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  36.01 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  35.31 
 
 		 477 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  35.14 
 
 		 420 aa  150  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  35.89 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  35.17 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  34.74 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  34.74 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  34.74 
 
 		 418 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  34.3 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  34.53 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  33.02 
 
 		 414 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  33.75 
 
 		 428 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  40.33 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  32.9 
 
 		 467 aa  138  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  33.94 
 
 		 420 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  35.02 
 
 		 408 aa  135  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  32.96 
 
 		 408 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  35.25 
 
 		 431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  32.79 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  34.76 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  34 
 
 		 417 aa  129  9.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  31.69 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  32.41 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  30.34 
 
 		 395 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  33.67 
 
 		 398 aa  123  9e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  34.48 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  36.75 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  36.75 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  36.75 
 
 		 443 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  32.79 
 
 		 410 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  32.99 
 
 		 494 aa  113  9e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  37.16 
 
 		 378 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  32.24 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  32.24 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  32.24 
 
 		 422 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  31.04 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  32.52 
 
 		 406 aa  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  28.53 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  34.92 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  32.16 
 
 		 570 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  31.01 
 
 		 438 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  31.01 
 
 		 438 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  31.01 
 
 		 438 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  33.12 
 
 		 428 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  33.12 
 
 		 428 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  33.12 
 
 		 428 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  33.54 
 
 		 455 aa  95.9  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  30.67 
 
 		 434 aa  94  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  32.46 
 
 		 429 aa  88.2  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3867  hypothetical protein  25.22 
 
 		 734 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0838155  normal  0.221167 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  29.39 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2388  hypothetical protein  25.69 
 
 		 469 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0205  hypothetical protein  24.88 
 
 		 734 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.746079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3146  Thiolase  25.35 
 
 		 468 aa  43.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.103603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>