208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2264 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 475 aa  895    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  49.25 
 
 		 452 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  45.59 
 
 		 473 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  47.64 
 
 		 453 aa  292  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  48.8 
 
 		 451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  48.8 
 
 		 451 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  49.01 
 
 		 451 aa  285  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  45.67 
 
 		 421 aa  283  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  45.92 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  43.89 
 
 		 482 aa  258  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  40.76 
 
 		 469 aa  223  4e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  38.49 
 
 		 470 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  39.11 
 
 		 488 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  39.87 
 
 		 475 aa  218  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  41.18 
 
 		 469 aa  216  5e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  39.2 
 
 		 488 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  37.53 
 
 		 471 aa  209  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  38.05 
 
 		 454 aa  194  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  39.32 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  37.72 
 
 		 477 aa  189  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  37.47 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  41.04 
 
 		 460 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  37.31 
 
 		 477 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  39.42 
 
 		 482 aa  173  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  35 
 
 		 479 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  35.41 
 
 		 482 aa  170  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  27.2 
 
 		 466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  27.2 
 
 		 466 aa  162  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  26.95 
 
 		 466 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  26.43 
 
 		 466 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  27.16 
 
 		 466 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  27.16 
 
 		 466 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  26.95 
 
 		 466 aa  158  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  26.32 
 
 		 463 aa  158  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  26.32 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  26.47 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  25.84 
 
 		 473 aa  156  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  25.84 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  25.89 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  26.05 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  26.67 
 
 		 473 aa  153  5e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  25.89 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  25.68 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  32.08 
 
 		 447 aa  152  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  31.61 
 
 		 488 aa  151  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  25.63 
 
 		 473 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  25.63 
 
 		 473 aa  150  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  25.63 
 
 		 473 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  25.42 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  32.98 
 
 		 473 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  32.15 
 
 		 490 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  32.37 
 
 		 470 aa  140  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  23.49 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  23.49 
 
 		 466 aa  137  5e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  27.14 
 
 		 479 aa  136  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  30.08 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  25.71 
 
 		 474 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  21.04 
 
 		 482 aa  133  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  32.79 
 
 		 488 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  24.89 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  28.19 
 
 		 491 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  29.91 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  28.17 
 
 		 509 aa  130  6e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  35.14 
 
 		 479 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  28.96 
 
 		 476 aa  128  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  27.98 
 
 		 470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  31.15 
 
 		 487 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  34.47 
 
 		 476 aa  114  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  30.58 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  31.94 
 
 		 502 aa  102  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  25.41 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  27.25 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  29.23 
 
 		 462 aa  89.4  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  25.61 
 
 		 495 aa  87.8  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  28.76 
 
 		 467 aa  87  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  27.22 
 
 		 470 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36040  protoporphyrinogen oxidase  32.95 
 
 		 531 aa  83.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0717647  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  25.46 
 
 		 469 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  26.26 
 
 		 471 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  27.54 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  25.4 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  24.78 
 
 		 475 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6583  FAD dependent oxidoreductase  29.69 
 
 		 435 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3436  protoporphyrinogen oxidase  33.5 
 
 		 492 aa  70.5  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000341133  decreased coverage  0.00125797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3433  putative dehydrogenase  30.23 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.51 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1328  hypothetical protein  26.95 
 
 		 423 aa  67.4  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  21.43 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4072  amine oxidase  26.3 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.693433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1045  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.687688 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  24.55 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  24.11 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  24.11 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  24.56 
 
 		 442 aa  63.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  20.68 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2774  amine oxidase  23.4 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.858792  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5828  amine oxidase  29.76 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0958  amine oxidase, flavin-containing  28.66 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  28.53 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0462  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>