34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2180 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2180  protein of unknown function DUF1304  100 
 
 		 127 aa  246  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.299642  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4598  protein of unknown function DUF1304  56.64 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2576  hypothetical protein  54.17 
 
 		 128 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1459  protein of unknown function DUF1304  58.41 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3823  hypothetical protein  52.54 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.314285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0374  hypothetical protein  53.98 
 
 		 129 aa  105  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1921  protein of unknown function DUF1304  58 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.980411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12650  predicted membrane protein  47 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.725167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0276  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75531  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0073  protein of unknown function DUF1304  36.21 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0508  protein of unknown function DUF1304  43.64 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  62.26 
 
 		 117 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  56.9 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  46.77 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  44.54 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  44.54 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4228  protein of unknown function DUF1304  48.15 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4116  protein of unknown function DUF1304  48.15 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532223  normal  0.15572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2834  hypothetical protein  42.37 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  hitchhiker  0.00331454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  58.93 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  51.79 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6325  protein of unknown function DUF1304  38.14 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  50 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0037  hypothetical protein  48.28 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  44.44 
 
 		 119 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  49.06 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0648  hypothetical protein  45.16 
 
 		 120 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  45.71 
 
 		 117 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0699  protein of unknown function DUF1304  48.28 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455556  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3500  hypothetical protein  51.67 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.395821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0584  protein of unknown function DUF1304  51.72 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1871  hypothetical protein  47.62 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.33795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1370  protein of unknown function DUF1304  44.74 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0191403  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1349  protein of unknown function DUF1304  36.59 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>