More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2137 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  100 
 
 		 549 aa  1083    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 		 566 aa  357  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 578 aa  345  8.999999999999999e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.83 
 
 		 559 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  38.17 
 
 		 572 aa  324  2e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 566 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 566 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 566 aa  317  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.04 
 
 		 575 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 		 571 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 		 568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 		 568 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.84 
 
 		 568 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  40.03 
 
 		 573 aa  306  7e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 595 aa  303  8.000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  41.14 
 
 		 573 aa  296  5e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  38.59 
 
 		 591 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  39.38 
 
 		 573 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 		 568 aa  284  4.0000000000000003e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  37.68 
 
 		 565 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  37.17 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 567 aa  280  5e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 580 aa  279  9e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  37.64 
 
 		 536 aa  277  5e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  37.98 
 
 		 578 aa  274  3e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.92 
 
 		 566 aa  269  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  36.82 
 
 		 543 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 592 aa  258  2e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.84 
 
 		 535 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 544 aa  247  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 		 556 aa  244  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 543 aa  244  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 568 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 535 aa  193  7e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  31.75 
 
 		 635 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 571 aa  182  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 590 aa  182  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 		 525 aa  180  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  48.65 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  51.81 
 
 		 392 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  49.71 
 
 		 588 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 		 456 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 		 631 aa  130  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 579 aa  130  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  39.22 
 
 		 401 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 		 386 aa  120  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 550 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 421 aa  108  4e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  35.12 
 
 		 373 aa  103  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  30.8 
 
 		 385 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 		 393 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  34.27 
 
 		 391 aa  97.8  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 409 aa  95.9  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  30.82 
 
 		 484 aa  94  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 372 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.67 
 
 		 665 aa  90.5  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3746  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 373 aa  89.4  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.200726  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  32.42 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4521  putative GAF sensor protein  32.21 
 
 		 851 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  36.47 
 
 		 828 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1315  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 344 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1385  sensor histidine kinase  22.85 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00939681  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4870  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 566 aa  77.8  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125677  normal  0.401535 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  28.3 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 351 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  26.07 
 
 		 351 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  31.36 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  27.36 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  26.89 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3278  ATPase domain-containing protein  28.44 
 
 		 563 aa  74.7  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.471224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3510  histidine kinase  27.75 
 
 		 559 aa  73.9  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.026405 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 775 aa  73.9  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 474 aa  73.9  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1374  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.82 
 
 		 613 aa  73.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0573196  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1961  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.82 
 
 		 598 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.68817 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1897  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.82 
 
 		 598 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.149462 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.24 
 
 		 582 aa  73.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1557  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.82 
 
 		 598 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0417714 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 345 aa  72.8  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 682 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  29.6 
 
 		 673 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3482  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 489 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.063872  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  28.27 
 
 		 596 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01200  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with NarL  30.23 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.690529  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1918  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.23 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0184147  normal  0.168413 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1902  nitrate/nitrite sensor protein NarX  29.82 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1372  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.23 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.497152  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 591 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  26.42 
 
 		 547 aa  72  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1331  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.23 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.150699  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1705  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.23 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.55706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0974  putative signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 584 aa  71.6  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01210  hypothetical protein  30.23 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.678292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2401  nitrate/nitrite sensor protein NarX  30.23 
 
 		 598 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>