More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2109 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2109  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
316 aa  621  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3310  glycosyl transferase family 2  61.26 
 
 
359 aa  369  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4235  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  63.82 
 
 
334 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.362311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4005  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  63.82 
 
 
334 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0113294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2187  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  63.82 
 
 
319 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.442863  normal  0.431936 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4079  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  63.82 
 
 
334 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.414972  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4508  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  64.85 
 
 
319 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11232  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  63.51 
 
 
324 aa  353  2e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.255662  normal  0.13294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06330  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  58.86 
 
 
312 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1165  glycosyl transferase family 2  58.76 
 
 
302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15820  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  48.55 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0138111  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0167  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  52.17 
 
 
315 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.33874  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2961  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  46.37 
 
 
334 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.720485  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0337  glycosyl transferase family 2  50.33 
 
 
320 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1732  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  44.98 
 
 
321 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.14375  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0338  glycosyl transferase family 2  51.62 
 
 
324 aa  227  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1730  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  44.01 
 
 
326 aa  226  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.645559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8126  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  42.95 
 
 
342 aa  217  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1142  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  41.54 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4157  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  43.31 
 
 
299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000365831  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2860  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  38.78 
 
 
325 aa  212  7e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2488  glycosyl transferase family 2  43.61 
 
 
335 aa  209  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000468454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1863  family 2 glycosyl transferase  46.28 
 
 
330 aa  202  4e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2312  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  34.58 
 
 
335 aa  190  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5332  glycosyl transferase family 2  38.94 
 
 
329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3452  putative glucosyl-3-phosphoglycerate synthase  48.47 
 
 
318 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.383504  normal  0.0411609 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0395  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 
510 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0548319 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06741  hypothetical protein  28.62 
 
 
402 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0870482  normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09131  hypothetical protein  34.25 
 
 
395 aa  85.9  9e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.554848  hitchhiker  0.00082103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0245  hypothetical protein  34.25 
 
 
395 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10451  hypothetical protein  32.32 
 
 
408 aa  82.8  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1195  glycosyltransferase-like protein  34.09 
 
 
365 aa  82.4  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.809596  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0837  hypothetical protein  32.32 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08961  hypothetical protein  31.82 
 
 
408 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.359171  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08941  hypothetical protein  31.31 
 
 
408 aa  79.7  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3045  glycosyltransferase-like protein  35.67 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0284255 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2244  hypothetical protein  33.7 
 
 
425 aa  75.9  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1772  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.56 
 
 
409 aa  75.9  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2607  hypothetical protein  32.6 
 
 
430 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.166847  normal  0.278323 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 
522 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1287  cell wall biogenesis glycosyltransferase  35.8 
 
 
373 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2601  hypothetical protein  25.89 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.625325  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0507  hypothetical protein  25.3 
 
 
408 aa  72.4  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.551714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6919  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00000675814  hitchhiker  0.000119796 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2603  hypothetical protein  26.22 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  30.85 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1389  glycosyl transferase family 2  32.92 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1612  glycosyl transferase family protein  36.22 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2163  cell wall biogenesis glycosyltransferase  25.25 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.407321  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1456  glycosyltransferase-like protein  33.53 
 
 
397 aa  66.2  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.443232  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2620  glycosyltransferase-like protein  30.73 
 
 
448 aa  66.2  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1685  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.908588  hitchhiker  0.00379696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2340  hypothetical protein  25.35 
 
 
404 aa  65.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122149  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2052  hypothetical protein  26.48 
 
 
405 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07780  glycosyl transferase family 2  34.55 
 
 
209 aa  65.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0071  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
393 aa  65.9  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0136  dolichyl-phosphate mannose synthase  31.63 
 
 
226 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1821  hypothetical protein  26.54 
 
 
416 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117561  normal  0.653656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1090  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
236 aa  64.3  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11948  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0737  hypothetical protein  29.88 
 
 
404 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1807  glycosyl transferase family 2  33.91 
 
 
222 aa  63.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2847  hypothetical protein  26.18 
 
 
406 aa  62.8  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.663115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0773  hypothetical protein  29.25 
 
 
403 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
206 aa  62  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0420  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.95 
 
 
409 aa  61.6  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.414661  normal  0.295666 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3209  hypothetical protein  26.59 
 
 
406 aa  61.6  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1540  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
380 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0303814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  38.21 
 
 
693 aa  60.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2502  putative glycosyltransferase  23.28 
 
 
403 aa  60.8  0.00000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0127877  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0593  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
268 aa  60.5  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0654  hypothetical protein  28.83 
 
 
391 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613109  normal  0.861609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0966  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 
242 aa  59.7  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1890  hypothetical protein  26.96 
 
 
409 aa  59.7  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.116319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1452  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
299 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591361 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  29.17 
 
 
213 aa  59.3  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1589  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 
380 aa  59.3  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0747672  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02160  cell wall biogenesis glycosyltransferase  23.85 
 
 
407 aa  59.3  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409645  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1041  glycosyl transferase family protein  36.94 
 
 
222 aa  58.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0213116 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2129  hypothetical protein  27.51 
 
 
408 aa  57.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  29.95 
 
 
322 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4062  hypothetical protein  30.77 
 
 
356 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2567  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.76 
 
 
407 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0206766  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2574  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.76 
 
 
407 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00191842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2581  cell wall biogenesis glycosyltransferase  24.76 
 
 
407 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
389 aa  55.8  0.0000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4382  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
258 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01630  glycosyl transferase  30.23 
 
 
285 aa  55.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.76765 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  44.3 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3189  glycosyl transferase family 2  32.66 
 
 
279 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.343721  normal  0.0208978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
365 aa  54.7  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0562  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 
524 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 
285 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4812  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.62 
 
 
514 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  39.13 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0564  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 
514 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0480  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 
518 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0419  cell wall biogenesis glycosyltransferase  32.73 
 
 
518 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0489  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.73 
 
 
514 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>