More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2019 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2019  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  100 
 
 
393 aa  792    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0394877  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3449  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  54.02 
 
 
399 aa  379  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0539765  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22800  flavodoxin reductase family protein  51.65 
 
 
395 aa  364  1e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3991  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  52.32 
 
 
388 aa  363  2e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.730708  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3202  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.94 
 
 
440 aa  350  3e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0359  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  50.25 
 
 
398 aa  335  7.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.474699 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0815  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  46.94 
 
 
386 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1541  6,7-dihydropteridine reductase  49.22 
 
 
407 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.233161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3514  conserved hypothetical protein; K05916 nitric oxide dioxygenase  47.85 
 
 
393 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4884  6,7-dihydropteridine reductase  48.7 
 
 
414 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514085 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0944  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  49.22 
 
 
399 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0916  oxidoreductase FAD-binding region  49.1 
 
 
400 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.12049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0933  oxidoreductase FAD-binding subunit  49.1 
 
 
400 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2229  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  45.73 
 
 
409 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0423  flavohemoprotein  45.71 
 
 
394 aa  319  6e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0668  globin  45.64 
 
 
386 aa  318  1e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.513137  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3654  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  44.97 
 
 
412 aa  310  2e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0203776  normal  0.336009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3526  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  47.26 
 
 
416 aa  305  7e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2937  globin  47.03 
 
 
404 aa  302  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000130596  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3143  oxidoreductase FAD-binding subunit  46.27 
 
 
403 aa  292  6e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.291  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22150  hemoglobin-like flavoprotein  45.09 
 
 
433 aa  289  6e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03510  hemoglobin-like flavoprotein  43.15 
 
 
394 aa  286  2.9999999999999996e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00690  flavodoxin reductase family protein  39.7 
 
 
422 aa  260  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3397  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.33 
 
 
395 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00458345  hitchhiker  0.00000182416 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3382  globin  41.77 
 
 
429 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3609  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.28 
 
 
401 aa  248  9e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3805  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  40.2 
 
 
407 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3287  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  41.03 
 
 
401 aa  247  3e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.888577  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3219  globin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  40.58 
 
 
406 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03522  nitric oxide oxidoreductase (Eurofung)  36.23 
 
 
426 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3398  flavohemoprotein (hemoglobin-like) transmembrane  40.83 
 
 
401 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5247  nitric oxide dioxygenase  37.44 
 
 
403 aa  229  5e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560073  normal  0.479596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0066  nitric oxide dioxygenase  34.34 
 
 
396 aa  215  9e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762787  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0639  globin  37.22 
 
 
402 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0194  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  35.9 
 
 
399 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0685  nitric oxide dioxygenase  33.33 
 
 
400 aa  205  9e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5531  nitric oxide dioxygenase  36.52 
 
 
403 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.313163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2649  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.05 
 
 
402 aa  202  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0504658 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3472  globin  33.83 
 
 
396 aa  202  9e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1294  flavohemoprotein  35.32 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3174  globin  35.14 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0240217  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0737  globin  36.34 
 
 
402 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.069446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0653  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  36.43 
 
 
402 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309595  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0253  globin  36.34 
 
 
402 aa  199  5e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51090  nitric oxide dioxygenase  38.4 
 
 
393 aa  199  7e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.901992  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0627  globin  36.19 
 
 
402 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.286968  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC07160  response to stress-related protein, putative  34.91 
 
 
504 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1093  nitric oxide dioxygenase  35.09 
 
 
394 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3077  globin  35.34 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000617748  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2996  globin  35.34 
 
 
397 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000576435  normal  0.181958 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3841  nitric oxide dioxygenase  35.31 
 
 
402 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0504612  hitchhiker  0.000000000204687 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1571  nitric oxide dioxygenase  35.31 
 
 
402 aa  196  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0701214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0705  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  35.87 
 
 
402 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.727633  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0848  nitric oxide dioxygenase  33.25 
 
 
398 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1540  nitric oxide dioxygenase  35.56 
 
 
402 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000194856 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1357  nitric oxide dioxygenase  35.56 
 
 
402 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3823  hemoglobin-like flavoprotein  36.98 
 
 
402 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1467  nitric oxide dioxygenase  35.56 
 
 
402 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0452  oxidoreductase FAD-binding protein  36.99 
 
 
393 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.366761  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1610  nitric oxide dioxygenase  35.56 
 
 
402 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000147718  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00087  nitric oxide dioxygenase  32.58 
 
 
394 aa  193  4e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1372  nitric oxide dioxygenase  34.57 
 
 
402 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0901987  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3639  nitric oxide dioxygenase  33.92 
 
 
396 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.994278 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1331  nitric oxide dioxygenase  35.31 
 
 
402 aa  193  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1330  nitric oxide dioxygenase  35.31 
 
 
402 aa  193  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002266  flavohemoprotein  32.16 
 
 
394 aa  193  5e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1174  nitric oxide dioxygenase  35.38 
 
 
402 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.631492  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1504  nitric oxide dioxygenase  34.32 
 
 
402 aa  193  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3293  flavohemoprotein  34.58 
 
 
402 aa  192  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3338  flavohemoprotein  34.57 
 
 
402 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3326  flavohemoprotein  34.58 
 
 
399 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000871976  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0832  nitric oxide dioxygenase  34.91 
 
 
392 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56489  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0808  nitric oxide dioxygenase  34.91 
 
 
392 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1083  globin  33.75 
 
 
397 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00013529  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2770  nitric oxide dioxygenase  32.01 
 
 
394 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1116  globin  33.75 
 
 
397 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0492814  normal  0.0284883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3275  globin  33.5 
 
 
397 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.54564  normal  0.0768709 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1014  globin  33.75 
 
 
397 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000980946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02444  fused nitric oxide dioxygenase/dihydropteridine reductase 2  33.83 
 
 
396 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1116  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  33.83 
 
 
396 aa  190  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2837  nitric oxide dioxygenase  33.83 
 
 
396 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2705  nitric oxide dioxygenase  33.83 
 
 
396 aa  190  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02408  hypothetical protein  33.83 
 
 
396 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1230  nitric oxide dioxygenase  33.5 
 
 
396 aa  190  4e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1125  nitric oxide dioxygenase  33.83 
 
 
396 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3786  nitric oxide dioxygenase  33.92 
 
 
396 aa  190  5e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07169  expressed flavohemoprotein (Eurofung)  33.01 
 
 
410 aa  189  5.999999999999999e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.100447  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2417  flavohemoprotein  34.33 
 
 
402 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0334  flavohemoprotein  34.33 
 
 
402 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2917  nitric oxide dioxygenase  33.58 
 
 
396 aa  189  7e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.744625  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2605  flavohemoprotein  34.33 
 
 
402 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1195  flavohemoprotein  34.33 
 
 
402 aa  189  7e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.699532  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0847  nitric oxide dioxygenase  34.66 
 
 
392 aa  189  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2705  nitric oxide dioxygenase  33.67 
 
 
396 aa  189  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.963286  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3045  nitric oxide dioxygenase  33.92 
 
 
396 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.55248  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2185  globin  32.83 
 
 
400 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0446  nitric oxide dioxygenase  32.41 
 
 
396 aa  187  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000301017  hitchhiker  0.00000364036 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1264  nitric oxide dioxygenase  32.41 
 
 
396 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1972  oxidoreductase FAD-binding subunit  34.67 
 
 
403 aa  186  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2134  nitric oxide dioxygenase  33.91 
 
 
414 aa  186  8e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>