More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1992 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1992  Silent information regulator protein Sir2  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1314  Silent information regulator protein Sir2  57.85 
 
 		 273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.170903  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05780  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  52.87 
 
 		 251 aa  238  6.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.577627 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06290  NAD-dependent protein deacetylase, SIR2 family  54.33 
 
 		 306 aa  236  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0975292  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11175  NAD-dependent deacetylase  53.11 
 
 		 237 aa  232  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0793  NAD-dependent deacetylase  48.59 
 
 		 251 aa  226  4e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000283822 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1959  NAD-dependent deacetylase  50.6 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2870  silent information regulator protein Sir2  52.57 
 
 		 258 aa  226  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.921414  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1963  NAD-dependent deacetylase  50.2 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0457  silent information regulator protein Sir2  44.92 
 
 		 266 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.489877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2070  silent information regulator protein Sir2  53.06 
 
 		 260 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2134  NAD-dependent deacetylase  50.41 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.626555  normal  0.354887 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0872  NAD-dependent deacetylase  50.79 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4062  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4137  NAD-dependent deacetylase  50 
 
 		 237 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1166  Silent information regulator protein Sir2  49.19 
 
 		 249 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00563616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4291  NAD-dependent deacetylase  49.59 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2090  silent information regulator protein Sir2  50.41 
 
 		 244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34038  normal  0.342768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2348  silent information regulator protein Sir2  51.14 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1074  Silent information regulator protein Sir2  48.39 
 
 		 249 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.269668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1341  silent information regulator protein Sir2  48.98 
 
 		 233 aa  211  7e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49820  cobalamin biosynthetic protein  51 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4570  NAD-dependent deacetylase  50.21 
 
 		 236 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245056 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0299  silent information regulator protein Sir2  46.56 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1230  hypothetical protein  49.19 
 
 		 246 aa  208  6e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00965516  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1627  Sir2 family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 255 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4244  cobalamin biosynthetic protein  52.23 
 
 		 250 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1593  silent information regulator protein Sir2  46.06 
 
 		 248 aa  204  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0601  silent information regulator protein Sir2  43.41 
 
 		 249 aa  202  3e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.496175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5402  Sir2 family transcriptional regulator  45.12 
 
 		 262 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282783 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4675  transcriptional regulator, Sir2 family  48.4 
 
 		 256 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.186649  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1904  silent information regulator protein Sir2  47.45 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2040  silent information regulator protein Sir2  45.6 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0033  silent information regulator protein Sir2  43.9 
 
 		 262 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1597  silent information regulator protein Sir2  46.69 
 
 		 244 aa  195  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33150  transcriptional regulator Sir2 family protein  45.57 
 
 		 243 aa  195  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.419253  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2323  Silent information regulator protein Sir2  44.66 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.687351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3171  silent information regulator protein Sir2  41.96 
 
 		 249 aa  191  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3017  silent information regulator protein Sir2  46.91 
 
 		 245 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.234408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0584  transcriptional regulator, Sir2 family  48.02 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0511686  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1260  silent information regulator protein Sir2  46.64 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0543594  decreased coverage  0.000122982 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0952  Silent information regulator protein Sir2  43.56 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.393847 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1777  silent information regulator protein Sir2  39.34 
 
 		 242 aa  183  3e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0202  Silent information regulator protein Sir2  41.11 
 
 		 245 aa  179  4.999999999999999e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000903537  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2038  Silent information regulator protein Sir2  43.62 
 
 		 245 aa  178  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4025  silent information regulator protein Sir2  44.72 
 
 		 284 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1612  Silent information regulator protein Sir2  45.75 
 
 		 260 aa  175  6e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.391649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2262  silent information regulator protein Sir2  45.34 
 
 		 260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.695636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2032  Silent information regulator protein Sir2  45.49 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375007  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0910  Silent information regulator protein Sir2  41.06 
 
 		 248 aa  172  5.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.44654  hitchhiker  0.00105872 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3557  silent information regulator protein Sir2  42.42 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1594  silent information regulator protein Sir2  39.3 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5854  silent information regulator protein Sir2  46.15 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1261  silent information regulator protein Sir2  40.94 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000136292 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1968  Silent information regulator protein Sir2  41.88 
 
 		 229 aa  163  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00937822  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4420  silent information regulator protein Sir2  46.85 
 
 		 226 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.910761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08031  hypothetical protein  39.59 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.580054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0687  silent information regulator protein Sir2  39.15 
 
 		 243 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3938  silent information regulator protein Sir2  45.98 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.137348 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0527  Silent information regulator protein Sir2  40.08 
 
 		 230 aa  159  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0790  silent information regulator protein Sir2  45.95 
 
 		 235 aa  159  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.706815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3213  NAD-dependent deacetylase  45.21 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2058  NAD-dependent deacetylase  41.44 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2473  NAD-dependent deacetylase  39.26 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.126045  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2345  NAD-dependent deacetylase  41.32 
 
 		 230 aa  157  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.870282 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3172  silent information regulator protein Sir2  37.89 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6362  Silent information regulator protein Sir2  42.99 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.177781  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02284  NAD-dependent deacetylase  39.27 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5448  Silent information regulator protein Sir2  38.78 
 
 		 229 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1711  NAD-dependent deacetylase  38.91 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003486  NAD-dependent protein deacetylase of SIR2 family  39.27 
 
 		 243 aa  156  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.657573  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02072  NAD-dependent deacetylase  38.62 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2005  NAD-dependent deacetylase  39.43 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0489143 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1604  NAD-dependent deacetylase  38.91 
 
 		 278 aa  155  7e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.422799  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0004  NAD-dependent deacetylase  42.47 
 
 		 234 aa  155  8e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0079912 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2203  NAD-dependent deacetylase  39.62 
 
 		 273 aa  155  8e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01118  NAD-dependent deacetylase  39.62 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2527  Silent information regulator protein Sir2  39.62 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000048723  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01126  hypothetical protein  39.62 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1500  NAD-dependent deacetylase  39.62 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000250063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2006  NAD-dependent deacetylase  39.62 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.423996  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1242  NAD-dependent deacetylase  39.62 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00135045  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2859  NAD-dependent deacetylase  38.91 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2481  NAD-dependent deacetylase  39.62 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142081  normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1843  NAD-dependent deacetylase  38.87 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000086586  normal  0.0231014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2781  NAD-dependent deacetylase  39.26 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0690424  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1116  NAD-dependent deacetylase  40.4 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2337  NAD-dependent deacetylase  40.5 
 
 		 240 aa  153  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1466  NAD-dependent deacetylase  41.85 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5013  silent information regulator protein Sir2  39.66 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.408464  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2892  silent information regulator protein Sir2  44.67 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2173  Silent information regulator protein Sir2  43.38 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1406  5,6-dimethylbenzimidazole phosphoribosyltransferase  38.37 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1622  NAD-dependent deacetylase  39.26 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1662  NAD-dependent deacetylase  37.25 
 
 		 248 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00629212  normal  0.0795648 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1635  NAD-dependent deacetylase  40.32 
 
 		 273 aa  150  3e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2817  silent information regulator protein Sir2  42.79 
 
 		 225 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1211  Silent information regulator protein Sir2  38.93 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000184843  hitchhiker  0.000443834 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0207  NAD-dependent deacetylase  42.36 
 
 		 234 aa  149  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.338339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1372  NAD-dependent deacetylase  37.18 
 
 		 242 aa  148  7e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000473909  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>