More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1967 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1967  cysteine synthase  100 
 
 
326 aa  657    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237562  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3871  cysteine synthase  74.07 
 
 
315 aa  490  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1728  cysteine synthase B  74.38 
 
 
315 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.285366 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1312  cysteine synthase  74.69 
 
 
320 aa  478  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0938  cysteine synthase  72.53 
 
 
315 aa  476  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.685376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7559  cysteine synthase  72.84 
 
 
315 aa  476  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3834  cysteine synthase  75.15 
 
 
323 aa  475  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.124032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1291  cysteine synthase  78.05 
 
 
328 aa  475  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2368  cysteine synthase  71.3 
 
 
315 aa  471  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3848  cysteine synthase  74.85 
 
 
323 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3922  cysteine synthase  74.85 
 
 
323 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29160  cysteine synthase  71.47 
 
 
316 aa  469  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1698  cysteine synthase  73.09 
 
 
317 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0137932  normal  0.120471 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2354  cysteine synthase  74.54 
 
 
324 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897277  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1358  cysteine synthase  71.17 
 
 
316 aa  468  1.0000000000000001e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1687  cysteine synthase  71.3 
 
 
315 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00358215  hitchhiker  0.00000672149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0383  cysteine synthase  71.91 
 
 
315 aa  466  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0544064  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4291  cysteine synthases  73.62 
 
 
320 aa  461  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.512917 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1011  cysteine synthase  71.47 
 
 
316 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1102  cysteine synthase  70.25 
 
 
321 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0868  cysteine synthase  71.91 
 
 
315 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5652  cysteine synthase  71.91 
 
 
315 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.397691  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0991  cysteine synthase  69.63 
 
 
337 aa  423  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.145876  normal  0.133112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1541  cysteine synthase  68.4 
 
 
316 aa  420  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1846  cysteine synthase  50.93 
 
 
323 aa  278  7e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.649243 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  44.3 
 
 
295 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  45.48 
 
 
296 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  45.16 
 
 
300 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  45.16 
 
 
300 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  45.81 
 
 
299 aa  246  3e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  44.19 
 
 
300 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3005  cysteine synthase B  44.01 
 
 
308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.951108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  44.52 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  44.52 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  43.55 
 
 
303 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  42.9 
 
 
295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  44.52 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1311  cysteine synthase  44.26 
 
 
302 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.933049  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  43.23 
 
 
300 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  43.23 
 
 
300 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  43.23 
 
 
303 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  43.23 
 
 
303 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  43.23 
 
 
303 aa  242  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  43.23 
 
 
297 aa  242  6e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  43.23 
 
 
303 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  43.65 
 
 
306 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  43.23 
 
 
301 aa  241  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  43.87 
 
 
300 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  42.9 
 
 
303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  43.55 
 
 
300 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  44.16 
 
 
300 aa  239  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0478  cysteine synthases  42.49 
 
 
773 aa  239  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00249553  hitchhiker  0.000140585 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  43 
 
 
311 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  43.23 
 
 
301 aa  238  6.999999999999999e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  43.32 
 
 
300 aa  238  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  43.09 
 
 
300 aa  237  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  44.52 
 
 
301 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  43 
 
 
300 aa  237  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  43.65 
 
 
300 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  43.04 
 
 
297 aa  236  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  43.23 
 
 
307 aa  235  9e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  42.9 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1096  cysteine synthase  43.28 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.365638 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3163  cysteine synthase  43.61 
 
 
354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  41.69 
 
 
299 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  43.55 
 
 
297 aa  233  3e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2993  cysteine synthase B  43.23 
 
 
300 aa  232  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  hitchhiker  0.00110964 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  41.69 
 
 
300 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  41.23 
 
 
300 aa  231  9e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0990  cysteine synthase B  42.9 
 
 
300 aa  231  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  43.23 
 
 
301 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0822  cysteine synthase  45.1 
 
 
307 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  42.53 
 
 
300 aa  229  6e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0170  cysteine synthase A  40.76 
 
 
304 aa  229  7e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00475319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  42.9 
 
 
294 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  42.9 
 
 
294 aa  227  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  41.29 
 
 
297 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0264  cysteine synthase  46.2 
 
 
308 aa  225  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.170266  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0830  cysteine synthase  42.19 
 
 
764 aa  224  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.246504 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  40.13 
 
 
313 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1036  cysteine synthase  41.56 
 
 
768 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.876649  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  40.45 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1322  cysteine synthase A  42.36 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353191  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2678  cysteine synthase  40.26 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1529  cysteine synthase A  41.72 
 
 
300 aa  220  3e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000033727  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  40.97 
 
 
295 aa  219  6e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  41.04 
 
 
303 aa  218  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  38.26 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  38.59 
 
 
312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  39.81 
 
 
299 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  39.61 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  43.17 
 
 
302 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  39.81 
 
 
299 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  38.19 
 
 
299 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  38.19 
 
 
312 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  39.81 
 
 
313 aa  215  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1166  cysteine synthase  39.87 
 
 
771 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  41.72 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3158  cysteine synthase B  45.87 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  38.69 
 
 
292 aa  213  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>