262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1959 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1959  nicotinate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
439 aa  866    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1286  nicotinate phosphoribosyltransferase  74 
 
 
455 aa  575  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1004  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.74 
 
 
437 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.704184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4297  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.14 
 
 
454 aa  537  1e-151  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.997092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3854  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.44 
 
 
440 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0484851  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3928  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.44 
 
 
440 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3840  nicotinate phosphoribosyltransferase  69.44 
 
 
440 aa  530  1e-149  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0914379  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29240  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  68.22 
 
 
433 aa  517  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.500225 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2348  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.59 
 
 
454 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.243675  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11362  nicotinate phosphoribosyltransferase  67.52 
 
 
448 aa  512  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000455701  normal  0.17111 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1693  nicotinate phosphoribosyltransferase  63.85 
 
 
438 aa  488  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0334582  normal  0.146455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1520  nicotinate phosphoribosyltransferase  63 
 
 
432 aa  481  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357665  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1097  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  61.06 
 
 
428 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3767  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  64.81 
 
 
430 aa  462  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0364426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1722  Nicotinate phosphoribosyltransferase  60.96 
 
 
428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.203111  normal  0.0930389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0986  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  60.6 
 
 
428 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.937586  normal  0.155542 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1352  nicotinate phosphoribosyltransferase  63.32 
 
 
427 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10690  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  60.18 
 
 
446 aa  436  1e-121  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.132626  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0380  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.35 
 
 
433 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132237  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1052  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.77 
 
 
465 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1489  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.05 
 
 
433 aa  425  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1320  nicotinate phosphoribosyltransferase  59.22 
 
 
465 aa  426  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6984  hitchhiker  0.00295081 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0933  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.74 
 
 
424 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.570353  normal  0.55165 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1692  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.66 
 
 
443 aa  424  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  hitchhiker  0.00000832621 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5658  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.86 
 
 
473 aa  419  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3876  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.9 
 
 
450 aa  419  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.210079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  55.02 
 
 
438 aa  412  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2742  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.27 
 
 
442 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2586  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  54.44 
 
 
442 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1307  nicotinate phosphoribosyltransferase  58.03 
 
 
439 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2318  nicotinate phosphoribosyltransferase  54.46 
 
 
442 aa  402  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000251567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2863  nicotinate phosphoribosyltransferase  56.07 
 
 
454 aa  401  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0781042  normal  0.0115492 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0330  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
445 aa  393  1e-108  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08320  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  54.67 
 
 
450 aa  394  1e-108  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  59.09 
 
 
440 aa  387  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.473276  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0860  nicotinate phosphoribosyltransferase  57.11 
 
 
461 aa  387  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2828  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  52.29 
 
 
440 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.11088  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0882  nicotinate phosphoribosyltransferase  55 
 
 
443 aa  378  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20100  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  52.05 
 
 
462 aa  374  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1032  nicotinate phosphoribosyltransferase  50 
 
 
440 aa  360  3e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1559  nicotinate phosphoribosyltransferase  52.52 
 
 
443 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4654  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.12 
 
 
453 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3577  nicotinate phosphoribosyltransferase  39.12 
 
 
453 aa  253  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.924497  normal  0.771098 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0513  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.85 
 
 
487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0797  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.82 
 
 
485 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1180  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
458 aa  242  1e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.690233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2471  nicotinate phosphoribosyltransferase  42.64 
 
 
451 aa  241  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0320218  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1212  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  36.55 
 
 
446 aa  239  1e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0716961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2593  nicotinate phosphoribosyltransferase related  35.28 
 
 
458 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0284  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 
488 aa  235  1.0000000000000001e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1325  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.08 
 
 
462 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1046  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.67 
 
 
489 aa  233  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.655171  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0996  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.12 
 
 
501 aa  233  7.000000000000001e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0354541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0664  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.72 
 
 
487 aa  229  9e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.38019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0635  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.14 
 
 
487 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.821455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4703  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.14 
 
 
487 aa  228  1e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1177  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.56 
 
 
486 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0494715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0724  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 
487 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0507  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 
487 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0511  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.14 
 
 
487 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0509  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.43 
 
 
487 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3836  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
485 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0322574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0653  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.54 
 
 
487 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000067551 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2987  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.85 
 
 
479 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1009  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.53 
 
 
460 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.948322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0565  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.54 
 
 
487 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0596  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.54 
 
 
487 aa  226  6e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2627  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.7 
 
 
489 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1780  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.96 
 
 
441 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0763  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 
451 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2646  nicotinate phosphoribosyltransferase  41.37 
 
 
450 aa  223  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.159209  normal  0.0133276 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0890  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.25 
 
 
475 aa  223  6e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0939  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 
451 aa  223  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1969  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
489 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.411515  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2003  nicotinate phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
489 aa  221  9.999999999999999e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.675811  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0775  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.38 
 
 
451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.344543  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1528  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.9 
 
 
490 aa  220  3.9999999999999997e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.10447 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1538  nicotinate phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
491 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2602  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 
461 aa  220  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0122  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.93 
 
 
465 aa  220  5e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0155  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.49 
 
 
480 aa  218  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0195  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.07 
 
 
453 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1540  nicotinate phosphoribosyltransferase  35.29 
 
 
480 aa  217  4e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.809941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2289  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.16 
 
 
481 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10583  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.63 
 
 
463 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.127794  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2253  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.6 
 
 
484 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3666  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.84 
 
 
495 aa  213  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.335827  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1964  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.6 
 
 
484 aa  212  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0253491  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0827  nicotinate phosphoribosyltransferase  33.95 
 
 
460 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1011  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.55 
 
 
468 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4911  nicotinate phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 
489 aa  211  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489735  normal  0.186236 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09180  putative nicotinate phosphoribosyltransferase  34.63 
 
 
489 aa  211  2e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.346116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2373  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.52 
 
 
476 aa  211  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0112042  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1985  nicotinate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
447 aa  211  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000236264  hitchhiker  0.00837081 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0255  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 
456 aa  211  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2057  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.4 
 
 
445 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134189  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0281  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.49 
 
 
456 aa  211  3e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.168647  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0318  nicotinate phosphoribosyltransferase  34.68 
 
 
459 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0907  nicotinate phosphoribosyltransferase  38.26 
 
 
468 aa  210  5e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46230  nicotinate phosphoribosyltransferase  36.08 
 
 
452 aa  209  9e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>