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for query gene Gbro_1888 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 505 aa  992    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.62 
 
 		 512 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  56.99 
 
 		 509 aa  550  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  58.86 
 
 		 609 aa  544  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.89 
 
 		 646 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.89 
 
 		 646 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.68 
 
 		 646 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  56.13 
 
 		 493 aa  535  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  55.75 
 
 		 627 aa  525  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.85 
 
 		 511 aa  524  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  56.17 
 
 		 579 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.22 
 
 		 534 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.61 
 
 		 521 aa  425  1e-117  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.22 
 
 		 540 aa  420  1e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.98 
 
 		 494 aa  422  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  47.31 
 
 		 504 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.46 
 
 		 546 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.93 
 
 		 579 aa  282  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 790 aa  281  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.72 
 
 		 522 aa  256  5e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 528 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.67 
 
 		 522 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.33 
 
 		 529 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.93 
 
 		 478 aa  235  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.1 
 
 		 478 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.67 
 
 		 504 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.27 
 
 		 498 aa  229  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  36.88 
 
 		 468 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.29 
 
 		 489 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.38 
 
 		 488 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.89 
 
 		 522 aa  224  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  34.35 
 
 		 530 aa  224  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.13 
 
 		 521 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.77 
 
 		 529 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.77 
 
 		 529 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  32.49 
 
 		 476 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.99 
 
 		 489 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  36.49 
 
 		 469 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.48 
 
 		 529 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.96 
 
 		 521 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.07 
 
 		 468 aa  213  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.75 
 
 		 524 aa  213  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0048  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.16 
 
 		 520 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4713  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 397 aa  210  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.02 
 
 		 520 aa  210  5e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.32 
 
 		 510 aa  210  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.82 
 
 		 626 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 		 486 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 		 486 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 		 486 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.85 
 
 		 514 aa  209  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  32.29 
 
 		 467 aa  208  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 		 486 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 		 486 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 		 486 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 457 aa  206  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.65 
 
 		 480 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  33.18 
 
 		 520 aa  207  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.93 
 
 		 520 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.54 
 
 		 502 aa  206  7e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.75 
 
 		 472 aa  206  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.1 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 477 aa  206  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.91 
 
 		 537 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.41 
 
 		 579 aa  206  1e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0066  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.86 
 
 		 520 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.97 
 
 		 534 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.33 
 
 		 520 aa  205  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.09 
 
 		 484 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.22 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.24 
 
 		 564 aa  204  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.41 
 
 		 478 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.29 
 
 		 520 aa  204  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1747  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.44 
 
 		 509 aa  204  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.128631 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.65 
 
 		 520 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834829  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0037  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.55 
 
 		 520 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0047  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.65 
 
 		 520 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.843987  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2091  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  30.44 
 
 		 509 aa  204  4e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.45 
 
 		 514 aa  204  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.82 
 
 		 478 aa  203  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0025  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.49 
 
 		 506 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.35 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0235  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.09 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.25 
 
 		 583 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.09 
 
 		 520 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.636069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1374  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.97 
 
 		 517 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.511847  hitchhiker  0.000280107 
 
 
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NC_007777  Francci3_0717  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.02 
 
 		 558 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.770491 
 
 
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NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.95 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_0023  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 		 520 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006348  BMA2770  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 		 520 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A3503  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 		 520 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.04 
 
 		 504 aa  200  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_3951  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.34 
 
 		 520 aa  200  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.909778  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU1480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.43 
 
 		 517 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.764278  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.61 
 
 		 515 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  28.27 
 
 		 503 aa  199  9e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
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NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.11 
 
 		 515 aa  199  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  28.39 
 
 		 582 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.16 
 
 		 534 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
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