More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1883 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05571  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring) (Eurofung)  43.85 
 
 		 1048 aa  723    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.532364 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00685  alpha-ketoglutarate decarboxylase  45.48 
 
 		 933 aa  746    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1498  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.43 
 
 		 954 aa  752    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0025  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.71 
 
 		 999 aa  734    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2910  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  45.48 
 
 		 933 aa  746    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.644532  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0324  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  41.67 
 
 		 905 aa  654    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.496099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2449  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.56 
 
 		 894 aa  778    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4189  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.48 
 
 		 943 aa  772    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0166  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.43 
 
 		 954 aa  752    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.673869  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2625  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.74 
 
 		 987 aa  775    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.835957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1952  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.63 
 
 		 937 aa  749    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1309  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.84 
 
 		 884 aa  681    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1269  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.04 
 
 		 953 aa  743    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_79721  alpha-ketoglutarate dehydrogenase  43 
 
 		 1015 aa  711    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0668593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1380  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.22 
 
 		 955 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2219  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.68 
 
 		 934 aa  712    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.67632  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1923  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.77 
 
 		 1004 aa  748    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1930  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.55 
 
 		 939 aa  723    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2199  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  46.61 
 
 		 943 aa  775    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1177  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.11 
 
 		 955 aa  653    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1158  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.11 
 
 		 955 aa  651    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1152  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.11 
 
 		 955 aa  651    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.659786  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1052  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.43 
 
 		 954 aa  752    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0597  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.28 
 
 		 936 aa  717    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0578  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.28 
 
 		 936 aa  715    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01730  oxoglutarate dehydrogenase (succinyl-transferring), putative  43.72 
 
 		 1055 aa  700    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2009  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.61 
 
 		 943 aa  775    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0102  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.69 
 
 		 961 aa  712    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2859  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.01 
 
 		 945 aa  717    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.256736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0566  alpha-ketoglutarate decarboxylase  61.16 
 
 		 1214 aa  1403    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.622687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2047  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.76 
 
 		 950 aa  753    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.738586  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4481  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.54 
 
 		 944 aa  675    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0255  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.99 
 
 		 912 aa  730    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0124838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1188  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.24 
 
 		 1001 aa  692    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.489523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0422  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.18 
 
 		 985 aa  764    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1924  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.43 
 
 		 954 aa  752    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283552  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0111  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.54 
 
 		 940 aa  759    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1614  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.48 
 
 		 943 aa  778    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.3492  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0965  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.74 
 
 		 992 aa  777    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2940  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.51 
 
 		 907 aa  757    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000647014  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4649  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.3 
 
 		 954 aa  763    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.355037 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2769  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.44 
 
 		 896 aa  772    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1270  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  40.11 
 
 		 955 aa  653    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0857  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.75 
 
 		 935 aa  740    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.813693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1213  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.05 
 
 		 987 aa  809    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326546  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2556  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.43 
 
 		 954 aa  753    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0781  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.51 
 
 		 939 aa  702    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0981915  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3748  alpha-ketoglutarate decarboxylase  60.84 
 
 		 1244 aa  1389    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0278  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.49 
 
 		 985 aa  781    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.268531 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1180  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.08 
 
 		 950 aa  716    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0832  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.83 
 
 		 912 aa  719    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0831  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.2 
 
 		 985 aa  777    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.270147 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2321  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.46 
 
 		 963 aa  707    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.676675  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2106  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.51 
 
 		 953 aa  724    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000654804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0191  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  48.76 
 
 		 991 aa  776    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2624  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.32 
 
 		 963 aa  722    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.844376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2812  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.46 
 
 		 953 aa  748    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.198639 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2183  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.04 
 
 		 940 aa  723    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0544  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.61 
 
 		 985 aa  783    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.898698  normal  0.505126 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1217  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.61 
 
 		 943 aa  777    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.718447  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0542  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  49.22 
 
 		 989 aa  768    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0111  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.57 
 
 		 961 aa  711    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1086  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.15 
 
 		 945 aa  748    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2050  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.52 
 
 		 950 aa  747    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.414377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3507  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  42.79 
 
 		 820 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0140  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.38 
 
 		 986 aa  715    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3511  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.74 
 
 		 983 aa  769    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.364999  normal  0.890777 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2228  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.19 
 
 		 940 aa  717    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.424063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1028  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.07 
 
 		 954 aa  761    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3973  alpha-ketoglutarate decarboxylase  71.71 
 
 		 1269 aa  1938    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2535  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.13 
 
 		 946 aa  671    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00287256  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1799  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.56 
 
 		 940 aa  749    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.243197  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3398  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.65 
 
 		 994 aa  750    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2013  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.76 
 
 		 952 aa  743    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.430973 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3362  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46 
 
 		 946 aa  778    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.044527 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0959  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.2 
 
 		 931 aa  717    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.292659  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1635  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.64 
 
 		 939 aa  726    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1710  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.64 
 
 		 939 aa  726    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.799991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3979  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.37 
 
 		 959 aa  723    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0538563 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2609  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.31 
 
 		 941 aa  780    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00855464 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2343  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.6 
 
 		 940 aa  726    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0982455  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2817  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47 
 
 		 994 aa  761    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.900682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1390  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.95 
 
 		 954 aa  759    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44010  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  46.02 
 
 		 943 aa  768    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2645  alpha-ketoglutarate decarboxylase  54.12 
 
 		 1277 aa  1399    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178892  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1508  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.07 
 
 		 954 aa  761    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3547  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  49.31 
 
 		 901 aa  814    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2395  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  47.99 
 
 		 981 aa  795    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106518 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1710  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.76 
 
 		 939 aa  728    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.150842 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0586  alpha-ketoglutarate decarboxylase  61.32 
 
 		 1233 aa  1399    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.577894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0555  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  45.94 
 
 		 988 aa  775    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0848498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1737  alpha-ketoglutarate decarboxylase  60.48 
 
 		 1263 aa  1366    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.765927  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1427  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  43.38 
 
 		 940 aa  698    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.345596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4047  alpha-ketoglutarate decarboxylase  71.71 
 
 		 1269 aa  1938    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2252  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 subunit  43.87 
 
 		 935 aa  721    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.392494  normal  0.744433 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4477  alpha-ketoglutarate decarboxylase  77.79 
 
 		 1262 aa  1863    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.655001  normal  0.23332 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1154  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.6 
 
 		 945 aa  741    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3248  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.25 
 
 		 959 aa  733    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1856  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.78 
 
 		 963 aa  727    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.61724  normal  0.555418 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1822  2-oxoglutarate dehydrogenase E1 component  44.09 
 
 		 958 aa  718    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.549181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>