More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1838 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1838  maf protein  100 
 
 
209 aa  407  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.244014  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4776  Maf-like protein  57.21 
 
 
209 aa  210  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.714834  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1041  maf protein  58.29 
 
 
214 aa  209  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.407711  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05870  Maf-like protein  57.14 
 
 
223 aa  205  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.538428 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1674  Maf-like protein  54.81 
 
 
209 aa  192  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0823  maf protein  53.37 
 
 
211 aa  184  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.017605 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0846  maf protein  50.24 
 
 
218 aa  177  1e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25490  MAF protein  50.91 
 
 
223 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.124397  normal  0.127791 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13311  Maf-like protein  48.83 
 
 
222 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3911  maf protein  49.3 
 
 
223 aa  170  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.487608  normal  0.0561371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1292  Maf-like protein  54.59 
 
 
210 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.981627  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1328  Maf-like protein  54.59 
 
 
210 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1309  Maf-like protein  54.59 
 
 
210 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.114265 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2443  maf protein  50 
 
 
195 aa  165  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6393  Maf-like protein  52.86 
 
 
206 aa  160  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1013  maf protein  50.47 
 
 
232 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.374037  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1035  maf protein  48.85 
 
 
221 aa  158  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.611513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1128  Maf-like protein  40.87 
 
 
196 aa  158  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3504  maf protein  50 
 
 
203 aa  158  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0163  Maf-like protein  38.35 
 
 
204 aa  156  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.74208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7197  Nucleotide-binding protein implicated in inhibition of septum formation-like protein  44.02 
 
 
257 aa  154  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21150  MAF protein  44.14 
 
 
235 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.1571  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4232  maf protein  47.85 
 
 
219 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.337108  normal  0.701882 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0836  Maf-like protein  40.87 
 
 
197 aa  152  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0679365  normal  0.0871977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4892  Maf-like protein  43.48 
 
 
195 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1140  maf protein  42.67 
 
 
229 aa  149  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08240  MAF protein  46.33 
 
 
226 aa  149  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106558  normal  0.448913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3574  Maf-like protein  39.42 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2532  Maf-like protein  39.42 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0095  maf protein  38.46 
 
 
197 aa  142  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0788  maf protein  42.03 
 
 
199 aa  135  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0794  maf protein  44.93 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0145497 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0851  maf protein  45.7 
 
 
226 aa  132  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1272  maf protein  37.27 
 
 
228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  46.67 
 
 
475 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0209  Maf-like protein  41.18 
 
 
208 aa  123  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.55094 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05680  MAF protein  42.72 
 
 
231 aa  122  4e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0768  maf protein  43.59 
 
 
184 aa  122  4e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16091  Maf-like protein  34.27 
 
 
211 aa  121  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.257914  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4366  maf protein  38.28 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0769  Maf-like protein  34.74 
 
 
211 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.91985  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1594  Maf-like protein  40.7 
 
 
211 aa  117  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.697875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1318  maf protein  39.91 
 
 
216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138128 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  43.28 
 
 
484 aa  116  3e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08381  Maf-like protein  41.75 
 
 
186 aa  115  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12351  Maf-like protein  33.33 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0455202 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13511  Maf-like protein  31.25 
 
 
203 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467144  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13361  Maf-like protein  30.29 
 
 
203 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.377788  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1258  maf protein  30.05 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.349097  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13261  Maf-like protein  30.88 
 
 
204 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0698999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2550  maf protein  34.22 
 
 
191 aa  94.7  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1485  Maf-like protein  39.29 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1520  Maf-like protein  36.6 
 
 
192 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.692511 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3805  Maf-like protein  37.11 
 
 
192 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334652  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1542  maf protein  32.84 
 
 
199 aa  90.9  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000755022  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0404  Maf protein  32.5 
 
 
220 aa  89.7  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0898  Maf-like protein  36.87 
 
 
191 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1909  Maf-like protein  36.08 
 
 
204 aa  89  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000270228 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2565  maf protein  28.57 
 
 
193 aa  89.4  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1720  Maf-like protein  33.66 
 
 
199 aa  87.4  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0513  maf protein  31.03 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0115044  hitchhiker  0.0000000008482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0087  maf protein  30.54 
 
 
200 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4188  Maf-like protein  32.35 
 
 
191 aa  87.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1613  Maf-like protein  33.01 
 
 
193 aa  87  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000203349  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2551  Maf-like protein  32.18 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4352  Maf-like protein  32.35 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4686  Maf-like protein  32.35 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.822481  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4542  Maf-like protein  32.35 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0936  Maf-like protein  36.76 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4546  Maf-like protein  31.71 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3686  Maf-like protein  33.5 
 
 
194 aa  85.5  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4199  Maf-like protein  31.86 
 
 
191 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.282568  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1933  maf protein  29.02 
 
 
197 aa  85.5  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.810739  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4573  Maf-like protein  31.77 
 
 
191 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0732375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4353  maf protein  32.37 
 
 
212 aa  84.7  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000929678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14260  maf protein  30.58 
 
 
192 aa  84.7  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.62439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2269  Maf-like protein  33.33 
 
 
195 aa  84.7  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0649  maf protein  31.63 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000733747  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00267  septum formation protein Maf  30 
 
 
196 aa  84  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.904611  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0661  Maf-like protein  30.73 
 
 
191 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1427  maf protein  36.08 
 
 
199 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.430559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1300  maf protein  26.13 
 
 
199 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.620785  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4588  Maf-like protein  31.37 
 
 
191 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.660835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4279  Maf-like protein  33.5 
 
 
203 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544566  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4300  Maf-like protein  32.81 
 
 
191 aa  82.4  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2545  Maf-like protein  32.5 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25610  Maf-like protein  37.09 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0482214  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1405  maf protein  30.24 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000139135  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1994  Maf-like protein  34.93 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.659233  normal  0.642936 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1468  maf protein  35.98 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3654  maf protein  35.57 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1366  maf protein  33.33 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.518192  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1607  maf protein  36.08 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.213904  normal  0.972679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3627  maf protein  31.34 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00981841  normal  0.308249 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2502  maf protein  31.84 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2400  Maf-like protein  27.72 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2394  Maf-like protein  33.49 
 
 
207 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.366012  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1564  maf protein  28.08 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2432  maf protein  34.9 
 
 
191 aa  78.6  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0363173  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1493  maf protein  30.93 
 
 
206 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000920267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>