More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1829 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 
522 aa  1003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4154  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  54.29 
 
 
516 aa  458  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.232645  normal  0.286804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3154  RemN protein  51.7 
 
 
519 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0215338  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  44.11 
 
 
528 aa  359  7e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  48.09 
 
 
469 aa  338  1e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.66 
 
 
522 aa  328  1e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3555  EmrB/QacA family drug resistance transporter  41.3 
 
 
527 aa  310  4e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21248  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  44.52 
 
 
499 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0353  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.61 
 
 
511 aa  275  1e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.252559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  42.93 
 
 
488 aa  274  2e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  38.67 
 
 
467 aa  268  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.71 
 
 
510 aa  266  7e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.69 
 
 
502 aa  265  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.88 
 
 
478 aa  259  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  6.83759e-05 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.64 
 
 
498 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  35.12 
 
 
500 aa  253  8e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3851  major facilitator superfamily MFS_1  34.06 
 
 
505 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3069  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.65 
 
 
504 aa  247  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.45 
 
 
504 aa  247  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.87 
 
 
528 aa  246  5e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.48 
 
 
478 aa  245  1e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.92 
 
 
486 aa  245  2e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.92 
 
 
486 aa  245  2e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.92 
 
 
486 aa  245  2e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.92 
 
 
486 aa  244  3e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.92 
 
 
486 aa  244  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.92 
 
 
486 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  42.13 
 
 
485 aa  242  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1319  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.1 
 
 
508 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.607602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.6 
 
 
478 aa  241  3e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.62 
 
 
521 aa  241  3e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.210467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.05 
 
 
532 aa  240  6e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.75 
 
 
478 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.35 
 
 
472 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.75 
 
 
484 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.39 
 
 
489 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4762  major facilitator transporter  33.99 
 
 
514 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.57 
 
 
534 aa  236  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2179  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.38 
 
 
587 aa  234  2e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00530113  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1745  RemN protein  35.1 
 
 
582 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.59 
 
 
478 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.28 
 
 
540 aa  233  4e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5330  major facilitator transporter  36.34 
 
 
512 aa  233  7e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.63801  normal  0.029348 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4378  major facilitator transporter  35.93 
 
 
512 aa  233  8e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0749958 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.04 
 
 
505 aa  233  9e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4956  major facilitator transporter  36.34 
 
 
512 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0729589 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3411  major facilitator transporter  36.34 
 
 
512 aa  232  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1730  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.05 
 
 
478 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.599699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.45 
 
 
468 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3663  major facilitator transporter  37.17 
 
 
512 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.691362  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0722  major facilitator transporter  34.29 
 
 
512 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.103556  normal  0.139751 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2687  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  40.64 
 
 
466 aa  230  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.594602  normal  0.701968 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0393  major facilitator transporter  36.28 
 
 
553 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.08 
 
 
489 aa  229  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.53 
 
 
487 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1255  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  37.14 
 
 
476 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.269768 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.42 
 
 
519 aa  227  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.27 
 
 
490 aa  227  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2915  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.74 
 
 
458 aa  227  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230559  hitchhiker  0.00656628 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4897  major facilitator transporter  34.86 
 
 
512 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672511  normal  0.0228989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  36.5 
 
 
497 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.16 
 
 
452 aa  226  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.65 
 
 
480 aa  226  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.48 
 
 
488 aa  226  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  33.79 
 
 
522 aa  226  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.89 
 
 
508 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0954  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.68 
 
 
458 aa  225  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 
545 aa  226  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  6.48651e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  35.73 
 
 
530 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.67 
 
 
763 aa  224  3e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4077  major facilitator superfamily MFS_1  33.12 
 
 
574 aa  224  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1372  multidrug resistance protein B  34.17 
 
 
534 aa  223  4e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.964869  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.71 
 
 
524 aa  223  6e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.57 
 
 
479 aa  223  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1557  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.52 
 
 
539 aa  223  7e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5514  major facilitator transporter  37.84 
 
 
483 aa  223  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5878  major facilitator transporter  37.84 
 
 
483 aa  223  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.307584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.31 
 
 
478 aa  222  1e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.26 
 
 
527 aa  222  1e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.53 
 
 
579 aa  221  2e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.5 
 
 
788 aa  222  2e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.08 
 
 
532 aa  221  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2180  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.58 
 
 
477 aa  220  4e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  37.84 
 
 
490 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  35.27 
 
 
519 aa  219  8e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1670  multidrug resistance protein B  28.76 
 
 
582 aa  219  8e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.11549  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.45 
 
 
474 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.86 
 
 
546 aa  218  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  38.71 
 
 
500 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3555  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.1 
 
 
583 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1646  multidrug ABC transporter, permease  28.54 
 
 
582 aa  218  3e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4144  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 
516 aa  218  3e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.94916  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.97 
 
 
534 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1911  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.72 
 
 
585 aa  217  5e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6387  major facilitator transporter  37.65 
 
 
480 aa  216  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  40.24 
 
 
487 aa  215  1e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.08 
 
 
520 aa  216  1e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  31.44 
 
 
582 aa  215  2e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3511  multidrug resistance protein B  30.45 
 
 
582 aa  215  2e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  36.27 
 
 
463 aa  215  2e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>